科匯堂是科研智庫平臺,由復旦大學、中科院和海外知名大學等頂級科研機構的教師、博士後聯合創辦,旨在為科研工作者提供一流的科研培訓和服務。
(報名後可不限次免費參加科匯堂同種課程;報名即送:30種常用科研軟體;多種軟體影片教程。)
引言:從Nature投稿要求說起
各大期刊均對投稿資料的有嚴格且細緻的要求,並在官網提供詳細的格式要求說明文件。以下以Nature為例解讀(完整pdf檔案可在Nature官網下載)。
該說明中涉及的格式要求,可以分為如下幾類:
1。 影象:
解析度(單位-ppi,彩圖一般要求300ppi、灰度圖1000ppi)
色彩模式(簡單來講分為RGB/CMYK,如設計印刷則是CMYK)
影象格式/大小(可接受格式有tiff、JPEG、pdf、psd,每種格式的優勢和場景不同)
文件中未提及,但實際更為重要的——科研影象處理倫理(採圖原則、影象處理分析方法/禁忌)
2。 圖表/示意圖:
字型大小(5pt~8pt,除圖示外,最大7pt、最小5pt)
字型-有襯線/無襯線、是否加粗(圖示文字要加粗、小寫字母,其他文字不建議加粗)
表格正文使用7pt的Helvetica或Arial字型
線條粗細(0。25-1pt)
格式:建議向量(ai、eps、pdf)
3。 排版
整圖尺寸(最大不超過18。3cm)
圖間隙(最小化)
論文資料視覺化概覽:
根據來源和格式,我們把資料大致分成以下三類。這三類資料及其相關軟體的使用,基本涵蓋了實驗結果整理和論文發表過程中的:What?Why?How?
影象:影象處理與分析
圖表:美化、格式
示意圖:繪圖
大圖排版
長按二維碼填寫報名表
課程大綱
第1天 科研影象處理
【主講老師】李博士 生物成像與影象處理領域資深專家,曾任中科院某所影像平臺主任。
【內容簡介】準確、高效、美觀的影象資料往往直接提升論文的影響因子檔次。影象處理也是科研工作者犯錯失誤的重災區。本部分課程主要講解影象基礎知識、軟體影象處理操作。軟體包括全能型影象軟體Photoshop,以及國際學術界使用最廣的科研影象處理軟體ImageJ。課程目的是讓學員做到:1-不犯錯影象錯誤;2-提升日常影象處理效率、準確度;3-具備部分高階影象分析能力。
第2天 論文作圖與排版
【主講老師】科匯堂視覺團隊共同開發課程。由具有學術背景的老師講授。
【內容簡介】高影響因子雜誌對示意圖、圖表排版的要求極高,Nature、JACS官網有專門供下載的圖表格式要求文件。但國內大部分科研工作者甚至都不曾讀懂,比如字型大小pt是如何設定?線條粗細1pt是什麼意思?300ppi又是什麼意思?本部分課程介紹論文配圖繪製、大圖排版、圖表美化和會議展報製作的實現,教學中強調實際操作,以保證學員在課程結束後有實際操作能力的提升。透過兩天的系統學習,即可輕鬆實現《Nature》級的圖表。
第1天:
科研影象處理
本部分課程從影象的基礎知識講起,逐漸過渡到軟體操作和應用案例實現。ImageJ是國際學術界使用最廣、最權威的開源影象處理軟體,且不存在收費和版權問題,遺憾的是在國內不夠普及。Photoshop功能強大,適用於科研工作中的各種日常場景。
1.1 科研影象基礎
解析度/影象尺寸計算、灰度/RGB/CMYK/HSB/Lab色彩模式及其應用、直方圖、調色:黑場/白場/中間色調(gama值)、白平衡、影象格式:tiff/gif/jpg/png
1.2 常用成像儀器採圖要點
鐳射共聚焦顯微鏡等成像裝置的採圖原理、及其資料處理差異、採圖引數要求
1.3 影象軟體
Photoshop:
核心概念:圖層/蒙版/曲線、調色:曲線/色階、影象裁剪、畫素/尺寸修改、自動拼接、測量、TEM照片上色、製作展示影片
ImageJ:
基礎操作、通道融合/拆分、影象調節深析、偽彩、去噪、影象運算、光照不均校正、加標尺批處理
1.4 案例解析:
病理切片分析、奈米球尺寸/粒徑分佈測量、光照不均校正/物鏡汙漬去除、白平衡、熒光強度定量分析、Western blotting條帶分析、細胞面積/體積測量、計數、共定位、製作展示影片
1.5 SCI雜誌對影象的要求
尺寸要求、採圖原則、後處理注意事項
1.6 科研影象倫理
不能有的操作、必須有的操作;提升質量的操作。
示例:共聚焦採圖標準
示例:白平衡校正
示例:多通道熒光影象處理
示例:不同種類噪點及去除
示例:熒光定量
示例:病理切片分析
示例:顯微鏡光照不均校正
示例:移除影象中的外源汙漬
示例:
Western Blot條帶分析
示例:
面積計算
示例:SEM照片上色
第2天:
AI繪圖與排版
本部分課程圍繞Adobe Illustrator(AI)在科研中的應用展開,包含:示意圖繪製、配色入門、Graphpad與AI聯用美化圖表、論文大圖排版、會議展報製作等。本部分側重操作,學員在老師的帶領下練習由簡單到複雜的案例。課程結束後學員有能力自己製作《Nature》級的圖表。
2.1 繪圖/設計基礎
向量繪圖原理、常見效果及其實現、配色/字型/排版、論文配圖要點及、SCI高分論文示例、兩色/三色搭配、主色/輔助色/點綴色、相近色/對比色、論文配色思路
2.2 AI
基礎操作、畫板/圖層、錨點/鋼筆工具;基本形狀繪製、形狀變換、旋轉、各種對齊操作;創造複雜圖形;漸變實現3D效果、用筆刷快速繪製重複單元(細胞膜、DNA等);符合SCI論文要求的匯出
2.3 配圖案例
繪製基本形狀/細胞器
訊號通路
奈米球結構
跨軟體協作:影象、圖形、圖表綜合應用
2.4 圖表最佳化
Graphpad/Origin圖表與AI的聯用、向量圖的匯出和格式
2.5 排版案例
論文大圖排版
學術會議展報製作
示例:基本圖形的繪製
示例:細胞膜的畫法
示例:示意圖繪製
示例:資料圖表美化
示例:多圖組合排版
FAQ:
沒有軟體怎麼辦軟體?
報名後我們會協助安裝軟體,可長期使用;
教學方式是怎樣的?
三段式:講解、跟隨操作、練習;
兩天課程能學到什麼水平?
所有學員掌握繪製常用影象處理/示意圖,足以應付日常應用場景;並具備以後自我提升的方法能力。
課後遺忘怎麼辦?
本課程學員可不限次免費參加科匯堂同種課程,以達到複習鞏固的目的。
報名資訊:
上課時間&地址(報名後傳送詳細地址):
2019年11月23-24日,北京
報名方式:
長按二維碼填寫報名表
註冊費用:
(提供正規發票。費用不包含晚餐、住宿。)
匯款方式:
A:銀行轉賬
賬戶名稱:上海合知堂資訊科技有限公司 賬戶號:03485500040015753
開 戶 行:中國農業銀行股份有限公司上海復旦支行
B:支付寶轉賬
支付寶賬號:service@kehuitang。com 支付寶戶名:上海合知堂資訊科技有限公司
C:現場刷卡或現金:支援公務卡
說明:匯款時請備註姓名,上課座次按到款順序排列
報名諮詢:
郵箱:training@kehuitang。com
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