《科研影象處理與作圖排版》

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科匯堂是科研智庫平臺,由復旦大學、中科院和海外知名大學等頂級科研機構的教師、博士後聯合創辦,旨在為科研工作者提供一流的科研培訓和服務。

(報名後可不限次免費參加科匯堂同種課程;報名即送:30種常用科研軟體;多種軟體影片教程。)

引言:從Nature投稿要求說起

各大期刊均對投稿資料的有嚴格且細緻的要求,並在官網提供詳細的格式要求說明文件。以下以Nature為例解讀(完整pdf檔案可在Nature官網下載)。

《科研影象處理與作圖排版》

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該說明中涉及的格式要求,可以分為如下幾類:

1。 影象:

解析度(單位-ppi,彩圖一般要求300ppi、灰度圖1000ppi)

色彩模式(簡單來講分為RGB/CMYK,如設計印刷則是CMYK)

影象格式/大小(可接受格式有tiff、JPEG、pdf、psd,每種格式的優勢和場景不同)

文件中未提及,但實際更為重要的——科研影象處理倫理(採圖原則、影象處理分析方法/禁忌)

2。 圖表/示意圖:

字型大小(5pt~8pt,除圖示外,最大7pt、最小5pt)

字型-有襯線/無襯線、是否加粗(圖示文字要加粗、小寫字母,其他文字不建議加粗)

表格正文使用7pt的Helvetica或Arial字型

線條粗細(0。25-1pt)

格式:建議向量(ai、eps、pdf)

3。 排版

整圖尺寸(最大不超過18。3cm)

圖間隙(最小化)

論文資料視覺化概覽:

根據來源和格式,我們把資料大致分成以下三類。這三類資料及其相關軟體的使用,基本涵蓋了實驗結果整理和論文發表過程中的:What?Why?How?

影象:影象處理與分析

圖表:美化、格式

示意圖:繪圖

大圖排版

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長按二維碼填寫報名表

課程大綱

第1天 科研影象處理

【主講老師】李博士 生物成像與影象處理領域資深專家,曾任中科院某所影像平臺主任。

【內容簡介】準確、高效、美觀的影象資料往往直接提升論文的影響因子檔次。影象處理也是科研工作者犯錯失誤的重災區。本部分課程主要講解影象基礎知識、軟體影象處理操作。軟體包括全能型影象軟體Photoshop,以及國際學術界使用最廣的科研影象處理軟體ImageJ。課程目的是讓學員做到:1-不犯錯影象錯誤;2-提升日常影象處理效率、準確度;3-具備部分高階影象分析能力。

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第2天 論文作圖與排版

【主講老師】科匯堂視覺團隊共同開發課程。由具有學術背景的老師講授。

【內容簡介】高影響因子雜誌對示意圖、圖表排版的要求極高,Nature、JACS官網有專門供下載的圖表格式要求文件。但國內大部分科研工作者甚至都不曾讀懂,比如字型大小pt是如何設定?線條粗細1pt是什麼意思?300ppi又是什麼意思?本部分課程介紹論文配圖繪製、大圖排版、圖表美化和會議展報製作的實現,教學中強調實際操作,以保證學員在課程結束後有實際操作能力的提升。透過兩天的系統學習,即可輕鬆實現《Nature》級的圖表。

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第1天:

科研影象處理

本部分課程從影象的基礎知識講起,逐漸過渡到軟體操作和應用案例實現。ImageJ是國際學術界使用最廣、最權威的開源影象處理軟體,且不存在收費和版權問題,遺憾的是在國內不夠普及。Photoshop功能強大,適用於科研工作中的各種日常場景。

1.1 科研影象基礎

解析度/影象尺寸計算、灰度/RGB/CMYK/HSB/Lab色彩模式及其應用、直方圖、調色:黑場/白場/中間色調(gama值)、白平衡、影象格式:tiff/gif/jpg/png

1.2 常用成像儀器採圖要點

鐳射共聚焦顯微鏡等成像裝置的採圖原理、及其資料處理差異、採圖引數要求

1.3 影象軟體

Photoshop:

核心概念:圖層/蒙版/曲線、調色:曲線/色階、影象裁剪、畫素/尺寸修改、自動拼接、測量、TEM照片上色、製作展示影片

ImageJ:

基礎操作、通道融合/拆分、影象調節深析、偽彩、去噪、影象運算、光照不均校正、加標尺批處理

1.4 案例解析:

病理切片分析、奈米球尺寸/粒徑分佈測量、光照不均校正/物鏡汙漬去除、白平衡、熒光強度定量分析、Western blotting條帶分析、細胞面積/體積測量、計數、共定位、製作展示影片

1.5 SCI雜誌對影象的要求

尺寸要求、採圖原則、後處理注意事項

1.6 科研影象倫理

不能有的操作、必須有的操作;提升質量的操作。

示例:共聚焦採圖標準

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示例:白平衡校正

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示例:多通道熒光影象處理

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示例:不同種類噪點及去除

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示例:熒光定量

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示例:病理切片分析

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示例:顯微鏡光照不均校正

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示例:移除影象中的外源汙漬

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示例:

Western Blot條帶分析

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示例:

面積計算

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示例:SEM照片上色

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第2天:

AI繪圖與排版

本部分課程圍繞Adobe Illustrator(AI)在科研中的應用展開,包含:示意圖繪製、配色入門、Graphpad與AI聯用美化圖表、論文大圖排版、會議展報製作等。本部分側重操作,學員在老師的帶領下練習由簡單到複雜的案例。課程結束後學員有能力自己製作《Nature》級的圖表。

2.1 繪圖/設計基礎

向量繪圖原理、常見效果及其實現、配色/字型/排版、論文配圖要點及、SCI高分論文示例、兩色/三色搭配、主色/輔助色/點綴色、相近色/對比色、論文配色思路

2.2 AI

基礎操作、畫板/圖層、錨點/鋼筆工具;基本形狀繪製、形狀變換、旋轉、各種對齊操作;創造複雜圖形;漸變實現3D效果、用筆刷快速繪製重複單元(細胞膜、DNA等);符合SCI論文要求的匯出

2.3 配圖案例

繪製基本形狀/細胞器

訊號通路

奈米球結構

跨軟體協作:影象、圖形、圖表綜合應用

2.4 圖表最佳化

Graphpad/Origin圖表與AI的聯用、向量圖的匯出和格式

2.5 排版案例

論文大圖排版

學術會議展報製作

示例:基本圖形的繪製

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示例:細胞膜的畫法

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示例:示意圖繪製

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示例:資料圖表美化

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示例:多圖組合排版

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FAQ:

沒有軟體怎麼辦軟體?

報名後我們會協助安裝軟體,可長期使用;

教學方式是怎樣的?

三段式:講解、跟隨操作、練習;

兩天課程能學到什麼水平?

所有學員掌握繪製常用影象處理/示意圖,足以應付日常應用場景;並具備以後自我提升的方法能力。

課後遺忘怎麼辦?

本課程學員可不限次免費參加科匯堂同種課程,以達到複習鞏固的目的。

報名資訊:

上課時間&地址(報名後傳送詳細地址):

2019年11月23-24日,北京

報名方式:

長按二維碼填寫報名表

註冊費用:

(提供正規發票。費用不包含晚餐、住宿。)

匯款方式:

A:銀行轉賬

賬戶名稱:上海合知堂資訊科技有限公司 賬戶號:03485500040015753

開 戶 行:中國農業銀行股份有限公司上海復旦支行

B:支付寶轉賬

支付寶賬號:service@kehuitang。com 支付寶戶名:上海合知堂資訊科技有限公司

C:現場刷卡或現金:支援公務卡

說明:匯款時請備註姓名,上課座次按到款順序排列

報名諮詢:

郵箱:training@kehuitang。com

微信:

電話:400-119-1986

微信公眾號:科匯堂

網站:www。kehuitang。com

學員作品 / 往期掠影:

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