晉代學者郭璞在《山海經圖贊》中說，玄龜聲如判木。判木就是砍伐木頭的意思，也就是玄龜聲可破木，一圍之樹木應聲而裂。可見殺傷力是相當強了。
現代的很多學者都認為，《山海經》中的玄龜就是南海鱷龜。理由是鱷龜的腦袋跟鳥兒很像，尾巴也是蛇尾那種光溜溜的樣子。
如果把它當成一個神話故事，玄龜就是不存在的，也沒有必要非得找到現實中的原型，因為神話本來就是虛幻縹緲的。如果玄龜真的存在過，而在現實中找不到對應的物種。就
有兩種可能，一種是它在古代曾經生活在九州境內，只是後來氣候不適應了，玄龜便滅絕了
。
而腎氣是人體的先天之氣，後天之本。腎臟也是其他身體器官生成的基礎，腎氣生腎臟，腎臟生腎氣，腎氣生肝氣，肝氣生心火，心火生脾胃，脾胃之氣生肺氣，肺氣再生腎氣，完成人體的氣機迴圈。按照這種說法，人體器官就是神龜口中的真氣所生。這看似離奇，也並非毫無根據。根據傳統陰陽五行的理論，腎屬水，真氣屬金，金生水。龜為水獸，理應屬水，腎臟為玄龜真氣所生也並非全無道理。
而玄龜也並非子虛烏有的“神話”，而是現實中存在的，只是現在還沒有找到鳥頭蛇尾的罷了。在體徵上，玄龜和巴西鱷龜的特徵十分相像。
《山海經》又說玄龜的聲音如同劈柴聲，“可以為底”很多學者都同意郭璞的說法，把“底”翻譯成“躪”也就是鞋子的意思，這樣是很難理解的。現代神話大師袁珂則將它譯為“胝”意為腳跟上的腳繭，這也同樣令人匪夷所思。
其實“底”還有根基的意思，可以引申為奠基。這在舊中國很常見，很多老房子的柱石底下都墊著一隻烏龜，有個專業的名詞叫贔屓（bi xi），一般是指石碑底下馱著碑石的烏龜。山海經中說佩戴烏龜可以讓耳朵聰慧，聽力不會遲鈍。這應該也是從腎臟五行屬水中延伸出來的聯想。腎臟屬水，開竅於耳，烏龜是水獸，所以對耳朵有好處。