同樣做雙熒光檢測,為什麼結果跟師兄差這麼多?

最近一直在做雙熒光素酶報告基因檢測,都已經一個多月了,熒光值偏低、轉染效率低、復孔重複性差……明明和師兄做的步驟一模一樣,為什麼結果卻相差這麼多?屁顛屁顛跑去問師兄,誰知他直接給了我一套實驗方案和常見問題分析答疑,受寵若驚,以後再也不用擔心實驗的問題啦。

你在做雙熒光素酶報告基因檢測實驗中還遇到過什麼問題?留言回覆

點贊前五名

的同學可

獲得鐳射翻頁筆一支

熒光素酶(Luciferase)

是自然界中能夠產生生物熒光的酶的統稱,其中最具代表性的是螢火蟲熒光素酶(Firefly luciferase)和海腎熒光素酶(Renilla luciferase)。熒光素酶可以催化 luciferin 氧化成 oxyluciferin,在 luciferin 氧化過程中,會發出生物熒光,可透過熒光測定儀測定 luciferin 氧化過程中釋放的生物熒光。

雙熒光素酶報告基因檢測實驗

包括兩種熒光素酶,即螢火蟲熒光素酶和海腎熒光素酶[1]。

這兩種熒光素酶作用方式不同。

一是底物和輔助因子不同,螢火蟲熒光素酶需要熒光素、O2、ATP 和 Mg2+,而海腎熒光素酶僅需要腔腸素(coelenterazine)和 O2。二是發光顏色不同,螢火蟲熒光素酶產生黃綠色光,發光波長為 560 nm;而海腎熒光素酶產生藍光,發光波長為 465 nm。

圖 1。 兩種熒光素酶檢測原理

實驗方案

藉助雙熒光素酶報告基因檢測實驗對啟動子結構進行分析驗證,可先對啟動子基本序列進行驗證,再對其核心區域進行驗證,實驗主要流程如下。

驗證啟動子序列

1、分析啟動子

根據已有資訊並利用各種生物資訊學線上軟體,初步確定目的基因啟動子可能所在位置。

2、構建載體

將預測序列構建到帶有報告基因的質粒上,構建表達載體。載體通常使用 pGL4。20 載體和 pRL 系列載體。

3、轉染表達

將所要檢測的質粒和帶有海腎熒光素酶基因的質粒轉染進入細胞內,擴增表達熒光素酶。

4、裂解檢測

加入細胞裂解緩衝液,添加發光底物,用熒光檢測儀或酶標儀進行檢測。

5、統計分析

藉助 GraphPad Prism5 等軟體進行繪圖,並分析實驗結果。

驗證啟動子核心區域

為尋找目的基因啟動子核心區域,首先分析目的基因啟動子區域的構成,將目的基因啟動子重要結構域進行缺失構建,接著將構建載體進行轉染表達,裂解檢測,最後對獲得資料進行統計分析,以此尋找驗證啟動子核心區域。

同樣做雙熒光檢測,為什麼結果跟師兄差這麼多?

圖 2。 實驗基本技術路線

常見問題及解決方案(DL101)

Q1 熒光值低

可能原因及解決方案如下:

Q2 復孔重複性差

可能原因及解決方案如下:

(1)實驗平行復孔(不同細胞孔):不同孔之間的數值影響因素較多。建議做同一個細胞孔裂解液的技術性平行來檢測試劑重複性。

(2)來源於同一個細胞孔的裂解液復孔:注意實驗操作、加樣順序、加樣速度及加樣量。檢查排槍加樣是否存在不均一問題。

(3)控制不同樣品和底物混合後至上機檢測的時間間隔儘量一致。

注:

熒光素酶報告基因實驗的檢測結果非常靈敏,復孔之間的數值有一定差異是正常的,一般認為在同一個數量級的差異是可以接受的。

產品推薦

你在做雙熒光素酶報告基因檢測實驗中還遇到過什麼問題?快來留言分享吧~

留言回覆點贊前 5 名:可獲得鐳射翻頁筆一支。

本活動於 2021 年 11 月 16 日 17 點截止,獲獎後會在公眾號後臺通知各位,歡迎留言,與我們分享你在雙熒光檢測實驗中遇到的問題。

內容策劃:劉果

內容稽核:吳軍

題圖來源:站酷海洛

【參考文獻】

[1]。 盧昂。 Sipa1 基因啟動子序列及其 SNPs 結構和功能研究 [D]。 華中科技大學, 2016。

TAG: 熒光素酶啟動子檢測實驗報告基因