隨著微生物研究的進步，及醫務營養工作者的努力 ，益生菌對人類的健康被越來越多的人認知。從出生那一刻起益生菌便跟著我們，開始了與人共生互利的生命旅程，誰也離不開誰。
正常菌群存在於我們的面板、口腔、胃部和腸道中，發揮著各自的作用，但是真正被稱作益生菌的菌群，目前被視為能夠耐受胃酸，成功定殖於腸道中，並能夠維持腸道微生態平衡的菌群。
目前研究表明益生菌可以
維持胃腸道健康、增強免疫力、促進營養吸收、合成營養素、降低抗生素的副作用等等。
獲得益生菌的途徑有哪些？
1、從母體中來
新生兒可以從母體的產道中、初乳中得到益生菌，並開始在腸道中定殖，也是寶寶腸道微生態環境建立的開始，定殖情況關乎到寶寶後期的腸道健康。
2、從發酵食品中獲得
比如酸奶、乳酪、醋、豆製品、醃製食品（泡菜）、酒等等。這是我們日常飲食生活中，最為常見的獲得益生菌的途徑，通常參與的益生菌有酵母菌、各類乳酸菌等
3、直接服用益生菌製劑
一些特殊人群及需要用益生菌預防或緩解某些健康問題時，可直接服用益生菌製劑。比如：
剖腹產的寶寶不能直接從媽媽產道中獲取益生菌可以出生時補充；
完全奶粉餵養的寶寶不能從初乳中獲取益生菌，出生後也可以適當補充；
腹瀉便秘期間服用益生菌可以得到緩解；
免疫力不佳和過敏體質的人群服用益生菌可以調節免疫力，改善體質。
益生菌怎麼吃效果好？
1、飯後30-60分鐘後服用
益生菌對胃酸很敏感，正常胃酸PH值為1。8左右，這樣的環境不利於益生菌的存活。因此需要找到胃酸低，即PH值相對較高的時機服用益生菌。
傳統認為嬰幼兒空腹時的胃酸PH值為4-5，但是據國內外研究發現，新生兒（28天內）空腹胃酸PH值為2。3左右，1歲以後PH值為1。9左右，已經接近成人水平，空腹時由於飢餓和受到食物誘導時，中樞神經會“指揮”胃部分泌更多的胃酸，這樣的環境顯然是不適合益生菌生存的。
此外，早上剛起床時分泌的胃酸較少，但是能否達到適合益生菌生存的PH值，還沒有找到理論依據，尚有爭論，因此不建議早上空腹食用益生菌。
進食後食物對胃壁的刺激，中樞神經進一步指導胃酸分泌增多，在胃部消化的初期，胃酸分泌逐漸達到高峰，因此在吃飯時補充效果也不太好，但比起空腹來說好得多；
在餐後半小時-1小時後，達到了飽腹感，胃酸的分泌有所減少，加之此時食物還在胃中，可以中和胃酸，PH值有所升高，大大減少了對益生菌的破壞，這期間攝入益生菌是比較適合的。
2、儲存益生菌的溫度不能太高
益生菌大多是不耐高溫的，溫度超過40攝氏度時活性便會降低並不可逆。為了保證益生菌的活性，當室內溫度高於20攝氏度時，建議可以放冰箱冷藏儲存。有些袋裝粉劑的益生菌，開封后如果沒有吃完，應該立即封口放冰箱或者丟棄，以免有害菌入侵，影響效果。
3、衝調水溫＜40℃
其實水溫不能超過37℃最好，避免高溫殺死益生菌。如果嬰幼兒不愛吃，想加在奶粉裡服用，不能先放益生菌，因為衝調奶粉的水溫一般都高於40攝氏度，可以將奶粉衝調好後，溫度低至37度時（手腕滴奶液溫熱無湯感），再加入益生菌。發酵製品中的酸奶、乳酪最好不要加熱吃，注意這類奶製品寶寶1歲以後才可少量攝入。
4、服用抗生素後2-3小時才能吃益生菌
抗生素在殺死有害菌的同時也會殺死益生菌，服用了抗生素後2-3小時再吃益生菌較合適。服用了抗生素後，補充益生菌可以降低抗生素對身體產生的副作用，比如因抗生素出現的腸炎性腹瀉。
5、選對益生菌種
益生菌種類繁多，每種益生菌的作用都有其特殊性，很多作用都需要進一步去研究，去發現，但是目前也取得了一些客觀的收穫，比如一些益生菌在腸道中的定殖位置，特殊作用等。舉幾個例子：
調理便秘：儘量選擇含有雙歧桿菌的益生菌，雙歧桿菌可以到達大腸並定殖，促進腸蠕動，幫助排便效果更好。
緩解過敏：可選擇含有羅伊氏乳桿菌的益生菌，這兩種菌在改善過敏性體質方面效果更佳。
感染性腹瀉：可選擇含有鼠李糖乳桿菌的益生菌。細菌或病毒引起的腹瀉，多屬於急性腸胃炎。這種腹瀉對腸粘膜損傷大，細菌引起的腸炎多會用到抗生素，對腸道產生副作用。鼠李糖乳桿菌具有排除腸道毒素，促進細胞分裂幫助腸粘膜修復的作用。
減輕乳糖不耐受：益生菌都有減輕乳糖不耐受的作用，不過嗜熱鏈球菌可以直接分泌乳糖酶，且定殖於小腸的上半部分，對緩解乳糖不耐受有更積極的效果。可是，嗜熱鏈球菌並不適合1歲以內的寶寶。
6、注意益生菌中的輔料
（選不對可能腹瀉加重噢）
有的益生菌粉劑的輔料中含脫脂乳粉、全脂奶粉、乳糖等。奶粉過敏的寶寶，在腹瀉期間應避開含有脫脂乳粉、全脂奶粉的益生菌；乳糖不耐受的寶寶需避開含有乳糖的。
就目前研究結果看來，益生菌對人類健康生存、對亞健康體質的調節表現出了不錯的效果，但是絕不能盲目將其看作治病防病的唯一良“藥”，合理正確地利用益生菌才能保證身體的健康。