明朝最大謎案，後世傳的沸沸揚揚，至今仍無答案
1399年8月，燕王朱棣誓師抗命，下諭將士，打著“清君側”旗號起兵“靖難”。在朱棣將大明王城攻下之後，百姓最關心的就是建文帝朱允文的下落。這位在位短短几年的皇帝，在被自己叔叔趕下王位之後，究竟會落得一個怎樣的下場呢？雖然朱棣起兵是打著清君側的名號，但是，只要是個人都知道，他的目的最終還是王位。
當李景隆將金川門開啟之後，卻四處都不見朱允文的身影。
到底朱允文去到了哪裡？他是不是還活著？當時的情況我們後人無從得知，這在當時，也是眾說紛紜，中間的真相如何無人知曉，於是，這也成為了明朝時期的一大謎案之一。
說到朱允文，他本身就是一個寬宏之人，他在位的時候，對外實行寬政，深得百姓的愛戴，所以，在事變發生之後，他的下落也就成為了百姓關心的焦點，無數的百姓都為他的遭遇而嘆息不已。
據史料記載，當時在朱棣開啟金川門之後，其實朱允文字來是想要親自出來迎接自己這位叔叔的，但是，想了一下，又嘆息道：我有什麼理由去見他呢？所以，他跟馬皇后最終就在寢宮中自焚而亡了。燕王在得知宮中燃起了大火之後，便急忙叫人前去救火，但是，為時已晚。
之後，宮人們在廢墟之中找到了建文帝的遺體，但是遺體早已被燒的面目全非。燕王更是悲慼萬分，抱著遺體就開始大哭，說自己無意搶奪皇位，只是為了清除皇上身邊的小人，皇上自焚又是何苦呢？不久之後，燕王用皇室之禮來厚葬了朱允文，並且，還讓百官都前來祭拜。
朱棣其實本性殘忍，在其登位後，他將忠於建文的諸臣剝皮的剝皮，下油鍋的下油鍋，把他們的女眷罰到教坊司當官妓，實行殘酷的“轉營”，即輪流送到軍營中去，一個女子每一日一夜要受二十餘男子的凌辱，情況還要經常報告朱棣，有被摧殘至死的，朱棣就下聖諭將屍體餵狗吃了。
但是，對於這件事情，許多人都並不相信，都保持懷疑的態度。因為朱棣登基之後，對這件事進行了封鎖，所以，這件事最終並沒有留下什麼明確的記載。永樂時期的官方歷史掩蓋了建文的年號而人為地把明太祖的統治時期延長了4年，即從洪武32年延長到洪武35年（1399年—1402年）：這個時期曾經被歷史學家稱之為”革除”時期。
公元一五七四年，當時年僅十二歲的明神宗曾經向朝中宰相問及過關於朱允文的去向，但是，最後得知這件事並沒有被記載到國史上。而根據民間流傳的說法，說當時建文帝在危難之際，剃掉了自己的頭髮，從皇宮裡的小路出宮，之後便一直在四處遊歷，沒有人知道他最後究竟去到了哪裡。
如今，隨著對建文帝去向的不斷深入研究，對於歷史資料的不斷更新，有愈來愈多的人認為當時建文帝並沒有在大火中被燒死，而是秘密的逃出了宮。
那麼，現在就有一個問題了，當時朱棣厚葬的到底是誰呢？
有人相信，當時躺在棺槨中的，其實是馬皇后。因為宮人們在廢墟中找到的那具遺體已經被大火燒的都認不出來了，所以，也沒有辦法準確的分辨此人到底是不是建文帝。並且在翻閱了歷史資料後發現，其中並沒有馬皇后的安葬紀錄。
並且，在明後期的時候，居然沒有一個人知道建文帝的陵墓在哪裡，從這也可以看出，當時的百姓並不認為建文帝是真正的死了。其實，不光是百姓，就連永樂帝自己也不確定，當時下葬的人，究竟是不是自己的侄子。但是，雖然他心中有懷疑，卻並沒有影響葬禮的舉行，因為他知道，只有這樣做，才可以讓百姓信服，自己才可以順利的登上王位。
甚至在萬曆《錢塘縣誌·紀制》記載：“東明寺在安溪大遮山前，建文君為僧至此，有遺像“。相傳朱允炆遁跡至此，時旭日始旦，題曰東明。自歸國後，方知為帝。今範其遺像。有手植牡丹，色白如銀“。明代嘉靖年間《留青日札摘抄》、清代康熙年間《湖堧雜記》中也都有記載。並且在東明寺大雄寶殿內殿柱上刻有如下對聯：
僧為帝，帝亦為僧，一再傳，衣缽相授，留偈而化；
叔負侄，侄不負叔，三百載，江山依舊，到老皆空。
谷應泰對於朱允文的下落，曾有過詳細的記載，並且，記載內容詳盡，很具有信服力。他覺得朱允文其實並沒有自焚而亡，而是在那些對他忠心耿耿的朝臣保護之下，從很少有人知曉的密道中偷偷逃走了。
究竟這位皇帝是自焚而亡了呢，還是從密道逃出了王城呢。對此，歷史學者們都有自己不同的觀點，所以，直到現在對於這件事並沒有明確的定論。當時在《明史》編撰的時候，那些負責的史官們也對此都持有不同的意見。甚至含糊其辭，說道：“宮中火起，帝不知所終。燕王遣中使出帝后屍於火中“。
其中有一位名叫徐嘉炎的史官就認為，朱允文並不是真的如宮中所說的那樣，死在了自己放的那把大火之中，而是偷偷的逃出了王城，他躲過了眾人的耳目，最後隱於山林之中。
其實在《恭閔帝本紀》曾對此有過記載，其內容大概是：王宮中起了火，帝王也因此下落不明。從這裡就可以看出，那個時候其實並沒有一個人可以拿出實質性的證據來證明自己就是正確的。
還有一個疑點就是，在當時王城淪陷之後，年僅七歲的大王子下落不明。朱允文共有兩位皇子，大皇子七歲，二皇子兩歲。在朱棣登基之後，二皇子就被幽禁在了廣安宮，並且之後度過了長達五十五年的幽禁生活。因為幽禁的時間太長，以至於在他被釋放出來的時候，連牛羊都無法分辨。
但是，大皇子卻一直都沒有被找到，既然兒子都可以逃脫，那沒有理由他自己卻無法逃出。並且，在城破之前，還有長達三年的時間讓他來準備此次的逃亡。