最近，科學家們開始深度挖掘腸道，大腦聯絡，腸道微生物組與心理健康之間的聯絡，力圖發現人類操縱腸道細菌來改善心理健康的方法。
2011年，加拿大麥克瑪斯特大學的一項研究首先發現，腸道自身能夠與大腦發生交流並影響行為。在這項研究中，科學家們對比了無菌小鼠與正常小鼠的行為。無菌小鼠不僅表現得十分冒險，而且其應急激素皮醇水平較高，大腦化學物質BDNF的水平也有所下降。較低水平的BDNF與焦慮症和抑鬱症的患病有關。
在《胃腸病學》期刊的研究中，科學家們表明他們可以替換小鼠的某種腸道細菌並顯著改變其行為。他們將一組膽小小鼠體內的微生物移植到冒險小鼠的腸道內，並觀察它們的性格變化。內向的小鼠變得活潑起來，厚顏無恥的小鼠變得敏感不安。研究負責人簡·福斯特表示：這很好地證明了微生物組會遮蔽這些行為。
有研究還顯示，我們的食物可以改變腸道菌群的組成成分和產物，與採用富含脂肪和碳水化合物的典型西方飲食的人群相比，尤其是以高纖維蔬菜為主食額人會具有不同的微生物成分或腸道環境。這不僅影響了代謝，也影響了大腦的功能。腸道變化可以影響大腦對消極事物或情緒激動影象的反應，這一事實令人難以置信。但這也充滿力量，這意味著，我們放入嘴中的食物以及我們養活腸道細菌的方式確實影響著大腦功能。
但是，我們也應該注意到大腦也是可以對腸道進行操控的。這會產生惡性迴圈，使心理壓力和焦慮增加腸道通透性並改變腸道細菌的組成，從而加劇腸道炎症和腸道的進一步滲透。
我們知道壓力過大會導致胃部不適，甚至與腸道疾病有關，而現在已有的科學證據可以解釋這種情況的發生機制。最新研究表明，就腸道通透性和炎症而言，慢性應激可能比急性應激更有害。該研究同時發現，腸道細菌在很大程度上控制著身體的應激反應。
在一項研究中揭示了壓力對於無菌小鼠的影響。果不其然，小鼠對壓力的反應過激。這些小鼠的HPA響應更為誇張，這意味著身體釋放了更多具有破壞性的皮質醇。而好訊息是，僅透過嬰兒雙歧桿菌的施加就可以恢復這種狀態。