朱廢丞相的根本原因是相權與君權的矛盾。直接原因是元朝丞相的專權和胡惟庸的跋扈和反叛。
一、相權和君權的矛盾
自從有了宰相這個職位，相權與君權就一直處於對立統一狀態。舉個不恰當的例子，皇帝就好像大財主，宰相就好像他的管家。一般家庭越富有，管家的位置就越重要而且事物繁雜。你說不要管家，取消中間商賺差價？人家世家大族要辦的大事太多，不要管家自己天天陷入家庭瑣事的小細節中，人生還有什麼意思？
但管家權勢太大，有時候就想侵吞主家財務自己做主。像水滸傳中盧俊義的管家李固。歷史上的王莽，曹操，楊堅就是典型例子。
所以皇帝既離不開宰相，又不得不防著宰相，所以從漢武帝開始用中朝架空丞相，隋唐用群相代替一個人獨相（三省長官都是宰相）。一群人思想總不好統一，皇帝就更安全不是。
二、元朝的丞相專權
可歷史發展到元朝，由於是少數民族入主中原，很多中原王朝的經驗因為蒙古人沒有學到精髓，蒙古人的管理又比較粗放，所以宰相專權又出現了。
元朝從三省變成中書一省，中書令一般由皇太子兼任，宰相一般由怯薛貴族擔任，到了泰定帝死後第一個大權相燕帖木兒基本上把持一切大權，接下來的脫脫，伯顏等丞相權勢滔天。而元順帝的太子更是因為兼著中書令，作為相權的代表天天想著提前接班，與他爹鬧得滿城風雨，成為元朝滅亡的原因之一。
三、明朝廢丞相之前
朱元璋建立明朝，開始時中央官制主要以元朝制度為藍本，中書省總領白管，李善長，汪廣洋，胡惟庸等為洪武朝歷任中書丞相。
不管胡惟庸謀反是真是假，胡惟庸利用中書大權，一定程度上矇蔽朱元璋，不利於自己的奏章文書朱元璋看不見肯定是存在的。
而朱元璋作為著名的雄猜之主，眼裡揉不得沙子，趁機拿下胡惟庸，解決兩千多年的君權和相權的矛盾，一腳踢開丞相，這些活老子都幹了。
可是後續子孫沒有朱元璋老農勤快，只得找幾個人幫忙幹活，於是內閣出現了。內閣權勢太大了，找幾個信得過的制衡一下，於是批紅權給了太監，於是明朝後期皇帝可以愉快地玩耍去了。