在道教中，有“十道九醫”之說，與醫學相關的神仙信仰有很多，如神農、岐伯、扁鵲、張仲景、華佗、葛洪、陶弘景、孫思邈等。
最著名的是唐代著名醫學家孫思邈，他著有《千金要方》、《千金翼方》，宋徽宗曾封其為“妙應真人”，孫思邈信仰較為普遍，很多宮觀或取名藥王廟、或設藥王殿供奉。孫思邈真人在道教被尊為“九天採訪三界藥王天醫大聖”、“藥王孫大真人”、“開元普度天尊”、“感應普救天尊”等。
農曆四月廿八為藥王孫思邈真人聖誕，持誦藥王寶誥，當願眾生，福壽康寧！
藥王寶誥
至心皈命禮
百家門上煉丹成，神虎巡風遊世界。
身穿龍袍，腳騰火輪。
凡民有難來相請，護助弟子救萬民。
千處有請千處應，萬處有請萬處靈。
屋宅化做黃金殿，病人化作天生人。
吃藥有效，用藥有靈。
消除災障，治邪亡魂。
二把老龍當眼看，唐朝香火救凡民。
起死回生如反掌，靈丹救濟世間人。
煉靈丹，治妙藥。
傳海上之仙方，引龍宮之妙訣。
大悲大願，大聖大慈。
大唐醫祖，濟世高隍天尊。
天資聰穎，立志度人
孫思邈祖師，京兆華原（今陝西耀縣）人，父母為耕織為業，養家餬口。自幼遭受風冷，缺吃少穿，身瘦力弱，經常生病，為尋醫看病，幾乎花盡了家的的收入和田產。七歲入學就讀，由於聰明過人，每日能誦讀千餘字，很受老師的器重。十七、八歲時，學問積累了不少，愛好讀論《老》《莊》及百家之說。有一次，洛州總管獨孤信路過華原，無意中遇到孫祖，驚奇地說：“這是一個聖童”。但深感受其見識高超而家境貧寒，將來不會被重用。
後周宣帝時，朝廷多故，社會動亂，孫思邈祖師隱居秦嶺太白山中。當時，大將軍楊堅輔政，下詔徵孫祖為國子博士。孫祖託疾不就任，在太白山繼續研究道教經典，探索服食養生術；同時，博覽眾家醫書，研究古人醫療方劑。他認為道在身內而不在身外，一個人只要潛心靜性、煉氣養形，雖無師傅指點，也可達到養煉目的。所以，孫祖拒絕世俗往來，傾心於道的修煉，並不絕總結前人養煉的寶貴經驗，而最終功滿道成，成了一名恪守道規，無師自通的道士。
孫祖不斷總結仙道經驗。他認為修道之士飛昇成仙，必須修德積善，積善愈多，仙階就愈高。他選擇了“濟世活人”的醫療保健，還制定了“救疾濟危”、“無慾無求”的標準，廣積善德，務欲成仙。醫離不開藥，他為了解中草藥的特性，深入太白山、終南山、峨嵋山的老林中，尋求藥農，多方採集，分類總結。後來，他所著的醫書中八百多種草藥，就是這個時期積累的。孫祖十分重視民間的醫療經驗，不斷積累走訪，及時記錄下來，他所收集的單方、驗方、名人名方，多達六千五百多個，在他的《千金要方》、《千金翼方》著作中，都有具體明晰的記載，可見其功夫之深。
出山輔政，為人師表
唐貞觀年間，長孫皇后懷孕已十多個月不能分娩，反而患了重病，臥床不起。雖經不少太醫醫治，但病情一直不見好轉。太宗愁鎖眉頭，坐臥不寧。徐茂功將孫祖推薦給太宗。孫祖受詔後，一面向皇后身邊的宮娥采女細問病情，一面認真審閱太醫的病歷處方，作了詳細的分析研究，已基本掌握了皇后的病情。然後，他取出一條紅線，叫采女把線系在皇后右手腕上，一端從竹簾拉出來，孫祖捏著線的一端，在皇后房外開始“引線診脈”了。沒有多大工夫，孫祖便診完了皇后的脈。原來，孫祖醫術神奇，靠著一根細線的傳動，竟能診斷清人體脈搏的跳動，這就是他被群眾稱為神醫的原因。
後經孫祖診治，皇后產下了皇子。孫祖不願在朝為官，立志漂泊四方為廣大人民群眾舍藥治病，並撰寫《千金方》濟世活人，向太宗陳述了自己的志願，婉言謝絕了太宗賜給的官位。太宗賜給他“沖天冠”一頂、“赫黃袍”一件、金牌一面、良馬一匹和千兩黃金、綢緞百尺。孫祖又拒絕了太宗賜給的黃金綢緞。唐太宗深為孫祖的高尚品德和為人處事的精神風貌所感動，同文武百官將他送出皇城，任他去名山大川採集藥材，為黎民百姓救死扶傷，任何人不得阻攔。唐太宗十分欣賞孫祖，後來還曾親臨華原拜訪孫祖，並賜他頌詞一首。直到現在，藥王山南庵內還留有唐太宗御道、“拜真臺”、“唐太宗賜真人頌”古碑一通等。
虎守杏林典故距今已有一千三百多年曆史，精研醫學併兼通玄門典籍，被譽為“藥王”的唐代著名醫學家孫祖晚年曾雲遊於邱縣。觀其景物優美，民風淳樸，遂留連忘返客寓郊寺，懸壺行醫無慾求，施醫無類，師承董奉為人治病不收錢，不受謝，惟望患者病癒後在寺旁植杏樹三株，經年植杏樹百畝，鬱然成林，杏熟以杏易谷賑貧。此間，有虎伏跪求醫，孫祖首創“虎撐”治癒金簪卡喉之疾，虎有靈性，不復危害人畜，感恩為其守護杏林並充當藥王坐騎。藥王佩逝，虎繞寺哀嘯三日，不知去向。
唐高宗永徽三年，孫祖根據多年來的行醫經驗，並會通古今，撰成了《備急千金要方》，共三十九卷，三百二十三門，方、論共五千三百首。其內容包括診療、針灸、導引、按摩等，相當全面。提出了“人命至重”的道家醫療觀點。書中記載了具體治療腳氣病的方法，比歐州人早一千多年。他把婦、兒科目放在卷首，以視重視；孫祖看到複方，一方可治多病或多方可治一病的方法。
永徽四年，全國瘟病流行，一時難以控制。一些僧道藉機以“秘丸”、“神丸”欺騙患者，大發橫財。這年四月，朝廷下令全國禁止僧、道遊醫為民治病，違者予以治罪。孫祖得知這個訊息後，遂隱居耀縣城東的五臺山。在五臺山中，他除了煉養氣功還精心煉丹製藥，以備將來為民治病。孫祖著《丹經》、《攝生真錄》、《福祿論》、《五兆算經》和《明堂經圖》，還為《老子》、《莊子》作了注，為道教的理論建樹，作出了貢獻。
顯慶二年，唐高宗詔令檢校中書令許敬宗等人會同名醫撰寫《唐新本草》。第二年，孫祖被召至長安，住在鄱陽公主舊宅。在編寫《新本草》過程中，他不僅對陶弘景《本草》《名醫別錄》作了訂正，並增補了百多種自己曾實踐有效的藥草。顯慶四年（公元659年）四月，圖文並茙的一部《唐新本草》撰寫完成，這是世界上首部國家藥典，共五十五卷，八百四十四種藥物。由於孫祖參編有功，唐高宗親自召見，並授予諫議大夫職，孫祖固辭不受，孫祖願到殿中省尚藥局工作。於是，高宗親授他承務郎。這承務郎屬從八品寄祿文散官，享受國家待遇。尚藥局無具體任務，僅是指導御醫診病和用藥。孫祖在此任上，因時間充裕，精研醫學和道教典籍。
孫祖因有高尚的醫德，精湛的學識，曾多次隨高宗出遊，並結識了不少當朝名士，書法家宋令文、醫藥學家孟詵皆拜師問道。太醫謝季卿，針灸學名醫甄權、甄言兄弟和藥性學家韋慈藏等，經常到孫祖居處研討學問和醫技。孫祖在特殊的情況下，還為朝廷命官看病治病。大理寺卿趙某患風溼性膝關節炎，入朝無法跪地，經孫針灸治療，月餘天氣，病患全除。還有“初唐四傑”之一的盧照鄰，懷才不遇，身患絕症，不能赴任，臥病長安，後經孫醫治，痊癒了。盧照鄰便拜思邈為師，並從師學習醫術推步、導引天文、養生等。盧照鄰後來，成為唐代很著名的“仙宗十友”之一。
唐高宗顯慶六年（公元661年），高宗讓權，武則天“稱制”。孫祖曾離京隱居嵩山修道。有一年，大旱不雨，武則天下詔選道德高尚的僧人祈雨，但無效；無奈，只好召孫祖入宮於內殿設壇行祈，當夜大雨。思邈說：“我修心五十年，不為天知，伊、洛二龍告訴我：若不是做有利於國家和人民的事，怎麼能昇仙？”後來，我撰寫了《千金方》行傳於世。
高宗咸亨四年，高宗患病，詔孫祖入宮，蒙高宗看重。上元元年，孫祖打算訂補《千金要方》，藉口患疾，請允還山。高宗感其忠誠侍御十六年，特賜良馬和原鄱陽公主封邑，後來，孫祖回到華原五臺山。於開耀元年，撰成三十卷《千金翼方》。是年冬天，孫祖無疾而終，享年141歲。孫祖遺囑弟子對其薄葬，不藏明器，不奠牲牢。停屍月餘，顏貌如生，色潤不改。入斂就棺時，發現衣裳空空，人們感到很奇怪，都認為是尸解成仙了。孫祖傳世著作達七十七種，加上一些節本總八十六種。其中最著名的《千金要方》《千金翼方》被後世奉為醫學聖典。
唐高宗咸亨二年，《千金要方》流傳到日本，視為國寶。宋英宗治平三年，林億奉詔修《千金要方》，刊佈於世。宋徽宗宣和四年，郭思刪節《千金要方》為《千金寶要方》，刻石於華州官署。明代宗景泰六年，楊勝賢木刻本傳世。明穆宗隆慶六年，刻《千金寶方》、《海土方》石碑於五台山。唐末，時人稱五臺山為“藥王山”，並建“藥王祠”。宋徽宗封孫祖為“妙應真人”，明世宗定他為“先臣”，清順治奉他為“神醫”。此後，“藥王孫祖”家喻戶曉人人皆知。
盧照鄰作為“初唐四傑”之一，當時在整個社會上名聲極大，文章詩歌流傳至今，時人都很佩服，他既然拜了孫真人為師，其他跟著來拜師的人也越來越多。
唐上元元年（674），孫真人年過百歲，功德圓滿，意欲出世，遂稱病請歸，高宗特賜真人良駒財寶等物、還有已故的鄱陽公主的宅邸讓其居住。當是時，盧照鄰患病，留住宅邸，遂有賦為證，其序雲：
癸酉之歲。餘臥疾長安光德坊之官舍。戶老雲：“是鄱陽公主邑司，昔公主未嫁而卒，故其邑廢”。時有處士孫思邈，道洽古今，學殫數術，高談正一。則古之蒙莊子，深入不二。則今之維摩詰。至於推步甲乙。度量乾坤，則洛下閎、安期先生之儔也。自雲開皇辛酉歲生，年九十三矣，察之鄉里，鹹雲數百歲。又共話周齊間事，歷歷如目見。以此參之，不啻百歲人矣。然猶視聽不衰，神彩甚茂。可謂古之聰明博達不死者也。
盧照鄰當時正值中年，不過四五十歲，就已經一身亂七八糟的毛病，而孫真人雖然年過百歲，看上去卻比自己更健康、更年輕，因而感慨道：“難道是我們先天稟賦不同，所以彼此的壽命與健康才有這麼大的差距嗎？”，因而便向真人討教道教養生之道：自己的疾病究竟如何才能痊癒？自己的壽命究竟如何才能延長？
真人哈哈一笑，悠然答道：
“我聽說善於談論天的人，一定要以人為參照；而善於談論人的人，也一定要以天的道理為依據。
天有四時的變化五行的運轉，春天和夏天的交替更迭。
天道運轉過程當中，平和就下雨，生氣就颳風，凝結就是霜雪，張揚就是虹霓。這是天地的規律。
人有四肢和五臟，有醒有睡，有呼有吸，迴圈往復，就形成人體的榮、衛之氣；彰顯出來就成為人的氣色神態；發動而為人的聲音。這是人的規律。
陽效能量用其精，陰效能量用其形，這是天與人相同的地方。等到失去這種正常現象，熱了就生熱，冷了就生寒；凝結就成為腫瘤；凹陷就成為毒瘡；奔躍就成為喘息、睏乏；竭盡就成為焦枯。病情呈現在表面，病變卻在形體內。把這種道理推及到天地方面也是這樣的。
所以，金、木、水、火、土，五大行星有盈有縮，星辰失去了常度，日與月的執行出現錯亂，彗星離開軌道飛行，這是天地的大病。寒暑不正常，這是天地間不和諧的表現。
岩石聳立泥土站著，這是天地的腫瘤；山崩地陷，這是天地的毒瘡；狂風暴雨，這是天地的喘息和睏乏；雨露潤澤不及時、江河干涸枯竭，這是天地焦枯的表現。良醫治病用藥石疏導，用針劑疏通；聖人用道德調和濟世，用政事輔助。
所以，人身上的疾病可以治好，天地間的災害也可以消除。
道理是死的，人是活的，在治病和養生的過程當中，需要活學活用，膽子要大而用心要細；心智要圓活而行為要方正。
《詩經》說：‘如臨深淵，如履薄冰’，說的是小心；‘赳赳武夫，公侯干城’，說的是大膽；‘不為利回，不為義疚’，講的是行為的方正；‘見機而作，不俟終日’，這是心智的圓活。”
孫真人的這些言論，都是史籍有載的，文采斐然，契合大道。
預言未來，入棺尸解
真人居於官舍期間，各地官宦名士紛紛前來拜訪、討教，東臺侍郎孫處約，曾經帶著五個兒子孫侹、孫儆、孫俊、孫侑、孫佺去拜見真人。真人說：“孫俊應當首先顯貴；孫侑應當顯達得較晚；孫佺的地位最高，災禍出在執掌兵權上。”後來都像他說的一樣應驗了。
太子詹事盧齊卿，向孫思邈請教仕途前景，真人說：“五十年後，你的官職可達一方諸侯之長，我的孫子會成為你的部下，你應當自己保重才是。”盧齊卿後來做了徐州刺史，孫思邈的孫子孫溥，果然是徐州蕭縣的縣令。孫思邈當初對盧齊卿說這話的時候，孫溥尚未出生，而他已預先知道了孫溥的事情。
真人的這些預言，在歷史在都有記載。
永淳元年（682），孫真人逝去，享年142歲。他在死前留下遺願，要求薄葬，不準在墓中放任何殉葬品，不準用活著的牛羊祭奠。一個多月之後，真人的屍身顏貌不改。當大家舉起他的屍體往棺材裡裝的時候，竟然只剩下空空的衣服而已，原來真人已然尸解而去。面對此情此景，時人全都驚歎不已。
孫真人生平註釋《道德經》《莊子》百餘卷，撰寫了《千金要方》三十卷、《福祿論》三十卷、《攝生真籙》、《枕中素書》、《會三教論》各一卷。《千金要方》流傳至今，影響甚大。
降妖伏魔，濟世度人
開元年間（713—741），又有人在終南山發現隱居的孫真人。與和尚宣律師相來往，宣律師常常來向真人請教參學。
當時天下大旱，有一個西域的僧人請求在昆明池修築神壇祈雨，皇帝唐玄宗下詔讓有關部門準備香燈蔬果，供僧人行法，誰知七天之後，不但沒有降雨，河水下降了幾尺。
某天夜裡，忽然有一位白髮老者前來拜訪宣律師，向他求救說：“弟子本是昆明池裡的老龍，天下大旱，不是因為我，而是因為胡僧要用我的腦袋做藥，卻欺騙天子說是在求雨！我的小命危在旦夕，請和尚用法力救護！”
宣公推辭說：“貧僧操守戒律、誦經參學罷了，哪有什麼法力？你可以去求孫思邈真人。”老人於是就來到孫真人住處，將事情緣由如此這般說了一通，真人聽完，狡猾地笑了笑，然後說道：“我知道昆明池龍宮裡有神仙藥方三十個，如果能讓我看看，我就救你。”
老人說：“這些藥方，昊天上帝並不準隨便外傳，現在事關緊急，我便將之傳與真人，又有何妨？”
過了一會兒，老人捧著藥方來了。孫思邈說：“你且回去，不用擔心胡僧。”
第二天，河水忽然暴漲，很快漫上岸來，胡僧羞怒而死，然後龍王如約降雨，解除了旱災。
某天，一個神仙從天而降，對孫真人說：“你所著的《千金要方》，救人的功德也很廣大了。但是其中的配伍卻是
以生靈為藥，殘害的性命也太多了
，因而你只能成為一個尸解的神仙，不能白天飛昇。”從此之後，孫真人採用
草木做藥，以代替虻蟲、水蛭的性命
，作《千金方翼》三十篇，每篇有龍宮仙方一個，行之於世人。與《千金藥方》一同流傳至今，這兩套著作，是為中華傳統醫學的核心經典之一，直到今天，也一直髮揮著濟世度人的文化功效。
功德圓滿，白日飛昇
此後，真人有時候隱沒，有時候出現。
鹹通（860—874）年間，終南山下的一家百姓，生了一個孩子，
十幾年不吃葷菜和帶血的東西
，父母認為他心懷慈悲，讓他到白水僧院做了童子。
某日，僧院中忽然來了一位遊客，自稱“孫處士”，在院中游了一週之後，從袖中取出一包湯藥碎末，交給這個童子說：“為我像烹茶那樣煎好。”煎好之後處士喝了一些，把剩下的湯汁給了童子。童子覺得湯汁的味道極美，希望再給他一碗。處士哈哈一笑，說道：“這碗藥就是為你來的！”於是便將一寸大小的湯藥碎末給了他，讓他煎著吃。周圍的僧人聽說了這事，都很好奇，便紛紛圍過來察看。
只見童子將孫處士送至門外，處士忽然騰空而起，童子也跟著飛了起來，眾人正在驚異，一看那煎藥的鍋子，已經變成金子，再扭頭，孫處士與童子雙雙消失在天際，竟然白日飛昇去也。
對於孫真人一生之功績，唐太宗李世民有言謂之：
鑿開經路，名魁大醫；
羽翼三聖，百代之師！
（典出《太平廣記•卷21•孫思邈》）
孫祖是古今醫德醫術堪稱一流的名家，尤其對醫德的強調，為後世的習醫、業醫者傳為佳話。他的名著《千金方》中，也把“大醫精誠”的醫德規範放在了極其重要的位置上來專門立題，重點討論。而他本人，也是以德養性、以德養身、德藝雙馨的代表人物之一，成為歷代醫家和百姓尊崇倍至的偉大醫學人物。
唐代名醫孫祖被尊為藥王，他卻不用動物入藥。他說：“自古名賢治病，多用生命以濟危急，雖曰賤畜貴人，至於愛命人畜一也。損彼益己，物情同患，況於人呼！夫殺生求生，去生更遠。吾今此方所以不用生命為藥者，良由此也。”（《備急千金要方》）
1、醫學鉅著《千金方》是我國曆史上第一部臨床醫學百科全書，被國外學者推崇為“人類之至寶”；
2、第一個完整論述醫德的人；
3、第一個倡導建立婦科、兒科的人；
4、第一個麻風病專家；
5、第一個發明手指比量取穴法；
6、第一個創繪彩色《明堂三人圖》；
7、第一個將美容藥推向民間；
8、第一個創立“阿是穴”；
9、第一個擴大奇穴，選編針灸驗方；
10、第一個提出複方治病；
11、第一個提出多樣化用藥外治牙病；
12、第一個提出用草藥喂牛，而使用其牛奶治病的人；
13、第一個提出“針灸會用，針藥兼用”和預防“保健灸法”；
14、系統、全面、具體論述藥物種植、採集、收藏的第一人；
15、第一個提出並試驗成功野生藥物變家種；
16、首創地黃炮製和巴豆去毒炮製方法；
17、首用胎盤粉治病；
18、最早使用動物肝治眼病，動物肝富含維生素A；
19、第一個治療腳氣病並最早用彀樹皮煎湯煮粥食用預防腳氣病和腳氣病的復發，比歐洲人 早一千年，彀樹皮富含維生素B1；
20、首創以砷劑（雄黃等）治療瘧疾病，比英國人用砒霜製成的孚勒氏早一千年；
21、第一個提出“防重於治”的醫療思想；
22、首用羊饜（羊甲狀腺）治療甲狀腺腫；
23、是我國曆史上第一位深入民間，向群眾和同行虛心學習、收集校驗秘方的醫生；
24、第一個發明導尿術。
志心稱念開元普度天尊，不可思議功德。
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