對於多數患者，主要緩解眼癢、眼紅等不適；對於長期發作或病情遷延患者，則以控制炎性反應狀態為主。儘量避免或減少接觸過敏原、改善生活環境有助於緩解和控制過敏性結膜炎病情。塵蟎過敏患者應做好室內清潔和除蟎工作，花粉過敏症患者則需要在花粉季節儘量採取保護措施。空氣汙染嚴重時患者應適當減少戶外活動時間。眼部清潔及涼敷能一定程度減緩眼癢等不適。
藥物治療
1。抗組胺藥：抗組胺藥區域性點眼僅可治療輕中度過敏性結膜炎。嚴重或頻發者可聯合口服抗組胺藥，但起效較慢，對於已經發作的過敏性結膜炎療效欠佳。使用口服抗組胺藥可能會加重乾眼患者的症狀，進一步加重眼部不適，須加以注意。閉角型青光眼患者慎用抗組胺藥。
2。肥大細胞穩定劑：肥大細胞穩定劑區域性點眼僅可有效減輕Ⅰ型超敏反應中肥大細胞的脫顆粒反應，從而減緩後續嗜酸性粒細胞、中性粒細胞和單核細胞的啟用和聚集。但此過程需3～5 d才能達到最佳效果，因此僅適用於過敏性結膜炎患者發作間期的病情控制。
3。抗組胺藥及肥大細胞穩定劑雙效藥物：抗組胺藥及肥大細胞穩定劑雙效藥物是治療過敏性結膜炎的首選基礎藥物，其可同時起到穩定肥大細胞胞膜和拮抗組胺的雙重作用，區域性點眼對於急性發作期的炎性反應和間歇期的炎性反應活化均有較好的控制作用。此外，臨床研究結果證實其既可以緩解症狀，又具有良好的耐受度 。對於急性期患者推薦使用該類藥物。
4。糖皮質激素藥物：糖皮質激素藥物區域性點眼能有效抑制多種免疫細胞的活化和炎性反應介質的釋放。適用於嚴重過敏性結膜炎和病情反覆遷延的患者。使用時間不宜過長，應注意隨訪觀察，以免引起白內障、青光眼、真菌感染及角膜上皮癒合延遲等併發症。
5。免疫抑制劑：免疫抑制劑如環孢素A、他克莫司區域性點眼，具有抑制多種炎性反應介質的作用，並可抑制由肥大細胞和T淋巴細胞介導的結膜過敏性炎性反應。對於重度過敏性結膜炎，尤其不耐受糖皮質激素藥物的患者，可考慮使用該類藥物的眼用製劑。目前臨床仍然缺乏使用該類藥物安全性的遠期隨訪資料，因此在使用該類藥物時應注意觀察患者病情變化，病情緩解後調整用藥。
6。其他藥物：人工淚液可稀釋結膜囊內的過敏原，潤滑眼表，緩解患者症狀。縮血管藥物區域性點眼可收縮血管，降低毛細血管通透性，減輕眼紅、水腫和分泌物增多症狀，但不能阻止炎性反應和緩解眼癢，不建議常規使用。非甾體抗炎藥（NSAIDs）區域性點眼可抑制Ⅰ型超敏反應中前列腺素的產生，適用於部分輕度的季節性過敏性結膜炎，對於急性過敏性結膜炎療效有限。
其他治療
對於伴有難以癒合的角膜上皮缺損或潰瘍的過敏性結膜炎，根據嚴重程度和性質，可考慮繃帶鏡、羊膜覆蓋或其他手術治療。