二、糖酵解
呼吸作用可以分為三個主要階段。第一個準備階段稱為糖酵解（glycoysis），第二和第三階段是發生線上粒體中的三羧酸迴圈和電子傳遞途徑。
糖酵解是指葡萄糖、葡萄糖-1-磷酸或果糖分解成丙酮酸的一系列反應，是糖的無氧酵解，在細胞質中進行。雖然糖酵解的部分反應可以在葉綠體或質體中進行，但這些細胞器均不能完成糖酵解的全過程。糖酵解反應所需要的酶，除己糖激酶外，都存在細胞質中。圖2-2列出了糖酵解的全過程。每一步反應都有特定的酶催化，每個中間產物都含有磷酸基。當一分子葡萄糖分解成二分子丙酮酸時，可由ADP和NAD+生成2分子ATP和2分子NADH，總反應式為：
糖酵解具有下列幾方面的功能：
糖酵解使一分子己糖轉變成二分子丙酮酸，併發生了部分氧化作用。雖然沒有O2的吸收和CO2的釋放，但發生了2分子NAD+被還原成NADH。每分子NADH進入線粒體氧化成NAD+可產生2分子ATP。部分不進入線粒體的NADH，在細胞質中推動生物合成過程。
2。ATP的產生。在糖酵解中既消耗一些ATP，又產生一些新的ATP。一分子葡萄糖和果糖分解成2分子磷酸丙糖，而每一分子磷酸丙糖轉化成丙酮酸時可產生2分子ATP，這樣一共生成4分子ATP。至於淨生產多少分子ATP則要看生成1，6-二磷酸果糖的途徑而異。葡萄糖和果糖進入糖酵解後，分別由己糖激酶和果糖激酶催化，各消耗1分子ATP形成葡萄糖-6-磷酸或果糖-6-磷酸。後由果糖-6-磷酸轉變成1，6－二磷酸果糖有兩條途徑。一條是由ATP-磷酸果糖激酶（ATP-PFK）催化的磷酸化作用，消耗1分子ATP。另一條途徑是70年代末至80年代初發現的由PPi-磷酸果糖激酶（PPi-PFK）催化的磷酸化作用，磷酸供體為焦磷酸。由此可見，由葡萄糖或果糖轉化成1，6-二磷酸果糖，如果透過ATP-PFK途徑，需用去2分子ATP；如果透過PPi-PFK途徑則只需要1分子ATP。因此，1分子六碳糖酵解淨生成2分子或3分子ATP。
3。糖酵解形成的中間產物可以用於植物其他物質的合成。詳見本章第四節。
4。糖酵解的產物丙酮酸進入線粒體進一步被氧化，產生比糖酵解更多的ATP。