竹鼠養殖成為養殖富熱門專案，竹鼠抗病力強，成活率高，在養殖過程 但大群飼養仍須做好防疫工作，主要有以下幾種疾病較常見。
外傷
常由於互相搶吃，竹鼠混群，爭窩室而互相咬傷，或是運輸時鐵籠鐵絲頭劃傷，傷口多在口腔、頭、預、腰和四肢，若不及時治療會因膿毒引起敗血症而死亡。輕微創傷塗以磺酒防感染，傷重者排出膿汁後，用消炎水。洗淨傷口，塗碘酒後撒上消炎粉，單獨飼料，以防再次致傷，必要時肌肉注射10～20萬單位青黴素。
腸胃炎
多由於飼料不潔，過量攝食含水分多的果蔬飼料或某些傳染病所致，表現為食慾減退、精神不振、拉稀、腹部和尾部被毛潮溼。該病一般透過觀察糞便進行診斷。患腸胃炎病鼠糞便通常顆粒與顆粒粘在一 起。正常糞便應是質地疏鬆，遇力即散，此病及早發現可治癒，中、後期死亡率較高。早期治療可用土黴素1片搗碎拌玉米粉或米飯喂飼，每天2次，2～3天可愈。
感冒
由於天氣突變，竹鼠被風吹雨淋受寒引起，病鼠呼吸加快，畏寒，流清鼻涕，減食或不食。治療可用複方氨基比林肌肉注射，每次0。5m1，每天2次。
中暑
主要因高溫引起，表現為騷動不安，呼吸急促，走動不穩，如醉酒狀。治療可將病鼠捉出埋入溼沙中，露出頭部，約15分鐘可甦醒。