1902年3月，魯迅先生與厲綏之、錢均夫一同踏上前往日本的旅途，而他們的目的就是前往日本東北大學進行留學深造。在學校進行學習的期間，魯迅識得了其口中的藤野先生，並結為良師益友。後在清國屢屢戰敗之下，決定棄醫從文，不久魯迅就離開他的學習。而魯迅在此後與藤野先生的交流依舊沒有停止，那麼後來的藤野先生究竟怎樣，過得如何呢？
青年魯迅
關於那時魯迅的人際關係寫道“仙台是一個市鎮，並不大；冬天冷得利害；還沒有中國的學生。”只因為他是該校第一位中國留學生。他在學校並沒有寫到自己的生活、身體狀態與自己以清國子民而被孤立的事情。而關於他老師的描寫只在《朝花夕拾》中，其中只寫了兩位老師。三味書屋的壽鏡吾老師與來自日本的藤野先生。藤野先生的形象是：“一個黑瘦的先生，八字須，戴著眼鏡”。
“我交出所抄的講義去，他收下了，第二三天便還我，並且說，此後每一星期要送給他看一回……原來我的講義已經從頭到末，都用紅筆添改過了，不但增加了許多脫漏的地方，連文法的錯誤，也都一一訂正。”， “但偏有中國人夾在裡邊：給俄國人做偵探，被日本軍捕獲，要槍斃了，圍著看的也是一群中國人；在講堂裡的還有一個我。”，“但在那時那地，我的意見卻變化了。”
魯迅（後排左）與朋友合影
“到第二學年的終結，我便去尋藤野先生，告訴他我將不學醫學，並且離開這仙台。他的臉色彷彿有些悲哀，似乎想說話，但竟沒有說。”“將走的前幾天，他叫我到他家裡去，交給我一張照相，後面寫著兩個字道：惜別”從藤野先生為魯迅每每訂正筆記到魯迅在異國他鄉受著同窗的排斥，在學生高喊「萬歲」的教室早已形成了鮮明的對比，從那時魯迅先生便也決定了棄醫從文的道路。最後與藤野先生道別時的人物神態與語言描寫更勝過千言萬語。
藤野先生在《謹憶周樹人君》中寫道：“周君身材不高，臉圓圓的，看上去人很聰明。記得那時周君的身材就不太好，臉色不是健康的血色。”、“可是在仙台，因為只有周君一箇中國人，想必他一定很寂寞。”、“那時社會上還有日本人把中國人罵為“梳辮子和尚”，說中國人壞話的風氣。所以在仙台醫學專門學校也有這麼一夥人以白眼看待周君，把他當成異己。”關於魯迅在生活與社交上的事情，藤野先生竟也記得。
1976年，藤野先生的侄子藤野恆三郎回憶道，魯迅逝世的那年（1936年），一名記者帶著魯迅逝世時的照片告訴了藤野先生關於他的訊息。就是這時，藤野先生將照片舉過頭頂，提寫了“謹憶周樹人君”。正是在此後，魯迅在日本留學期間的事情才得以完善，更豐富了魯迅“藤野先生”中的種種，其相互對彼此的人物刻畫也使對方的形象更加飽滿，更具色彩。
藤野嚴九郎紀念館
藤野先生其在1915年就因學歷不夠，而被迫於6月底提出“請求免職”，8月9日更被解除講師職務。1919年，失業的藤野先生則自己回到了開了一家故鄉自立診所。在日本宣佈投降的4天前，藤野先生在福井逝世。