作為兩江總督，清朝九位級別最高的封疆大吏中的一位疆臣——馬新貽，是清朝死於行刺最高級別的官員了。兩江地區自古以來都是朝廷的“錢袋子。所以這個位置，無論中央還是地方，都知道這其中的利害關係是什麼。
雖說兩江地區因為十幾年的動亂，已經是百廢待興。但是這一地區被曾國藩平定之後，還是很快趨於穩定，並且迅速有了發展和起色的。更為關鍵的是，彼時的時局已經今夕不同往日，兩江靠近沿海地區，正是西方列強的商品和思想滲透最為嚴重的地區。
這意味著，相比於國內的其他地區，這裡即便亂過，但是恢復平靜之後，其發展的勢頭還是不可阻擋的。而馬新貽作為慈禧的人，進入到了曾國藩曾經平定的地盤，無論從哪個角度看，這都是在私底下掀起了一場大的風浪。
朝廷的錢袋子，看管之人卻死了
馬新貽是從1868年接任兩江總督的，在此之前兩江總督的位置是空缺的，一直由江蘇巡撫李鴻章兼任。雖然總督比巡撫高一點，但是兩者之間沒有隸屬關係。而且，馬新貽接受兩江的時候，太平天國運動已經被平定4年了。兩江地區百廢待興，馬新貽此刻接任，壓力甚大。
但是接任兩年之後，誰都沒有想到馬新貽會被刺殺，1870年8月22日這天，正是夏天酷熱的時候，馬新貽去了總督府旁邊的訓練場地，觀看了清軍的日常訓練，而後步行返回了衙門門口。就在此時，刺客張文祥偽裝成一個送信的差役，一刀刺進了馬新貽的肋旁。
馬新貽沒有當場死去，到了第二天才重傷不治。這件事朝野震動，當時的江寧將軍魁玉趕緊上報了朝廷，垂簾聽政的兩宮太后也是吃驚不小。雖然是兩宮聽政，不過大事都還是慈禧說了算，她立刻下令魁玉兼領兩江總督，而後嚴審刺客。
不過這種事，用腳後跟都能猜出來沒啥結果，人已經被殺，不管有沒有幕後主使，目的已經達到，所以任憑怎麼嚴審，刺客張文祥就是什麼都不說，審問的急了，他就說刺殺馬新貽，是因為他不仁不義。這理由太牽強或者太虛，根本構不成刺殺的理由，可實情張文祥就是啥也不說，這可急壞了魁玉。
由於得不到任何的結果，慈禧太后十分震怒，畢竟這可是堂堂的封疆大吏，說被殺就被殺了，而且還是在總督府的衙門口。如果背後沒有主使，他一個小小的刺客怎麼能夠混進來？所以慈禧立刻又下令張之萬協同會審。
張之萬當時任漕運總督，之所以被命令去審理此案，是因為他和死去的馬新貽是同榜進士，所以這裡面有一定的同年之宜。慈禧的內心一方面是希望此案趕緊查清並了結，另一方面，她又不希望東南地區再生出什麼么蛾子來。
然而審理的結果還是不盡如人意，張文祥從前做過土匪，後又當過海盜，而馬新貽在做閩浙總督的時候，曾經大量的緝捕海盜，使得張文祥的很多同夥都被殺死了。所以張文祥這才想要殺死馬新貽，以便給自己的同夥報仇。
張之萬就將這樣的審理結果，上報給了朝廷。這個結論聽起來邏輯很合理，可是從馬新貽的身份角度去看的話，事情還是沒這麼簡單。慈禧心有不甘，但是她一時也不知道該怎麼去做。思來想去之後，慈禧只能咬著牙把那個人派出去了。
那個人就是曾國藩。
投鼠忌器才被調離兩江
曾國藩剿滅太平天國之後，被授予一等毅勇侯，而且可世襲罔替。但彼時的曾國藩已經不僅僅是位極人臣，更重要的是，他手裡握有重兵。在清廷看來，曾國藩如果在剿滅太平天國之後擁兵自重，清廷可以輕易地被其反噬。
不過清廷可以慶幸的是，曾國藩不是那樣的人，在太平天國被剿滅之後，清廷對於接下來的事宜處理，曾國藩對於朝廷的意見和命令可謂是唯命是從。湘軍事實上被就地解散了，但是曾國藩手下那些有功的將領，也都被加官進爵，成為了各地區的實權人物。
所以，即便曾國藩對朝廷是唯命是從，即便曾國藩沒有任何異樣的表現，可朝廷對他還是投鼠忌器，不敢輕易地將其放任。太平天國被剿滅之後，曾國藩曾經短暫地接任過兩江總督的職務，但是很快就被朝廷調離到其他任上去了。
因為至少在慈禧的眼中，曾國藩是“不老實”的。別看他表面唯首是瞻的樣子，當初攻破南京的時候，太平天國庫藏的大量銀兩，曾國藩可都沒有上繳國庫。這一點雖然曾國藩給出了合適的理由，但是在慈禧看來，其中很大的一筆財富都被曾國藩私吞了。
當然，這些也不過都是慈禧或者說清廷的猜測，並沒有切實的證據。但也正是這種猜忌，所以太平天國被平定之後，曾國藩才迅速地被調離了，就是因為擔心他在當地坐大。然而掉了一個沒有湘軍背景的馬新貽前去，卻被人刺殺。這難道不讓人浮想聯翩嗎？
如今事情處於膠著的狀態，慈禧的內心很清楚，要想徹底瞭解其中的真正內情，還必須得曾國藩前去才行。畢竟，兩江地區有很多曾國藩的舊部，只有他去，才能拿到朝廷想要的結果，也只有他去，他的那些舊部也才可能把知道的情況都說出來。
於是，在張之萬上報審理的結果之後，慈禧又派了刑部尚書鄭敦謹審理此案。而且，又將曾國藩從直隸總督任上調到兩江總督任上。慈禧的要求再明確不過，一定要將此案審理清楚。但是，曾國藩在接到朝廷的調令之後，卻稱病遲遲不動身，一拖就是幾個月過去了。
這讓慈禧很是不快，但是曾國藩這麼做，其內心也有諸多的想法。當時已經有流言四起，對湘軍背景的人員，甚至包括曾國藩他本人都不利。因此從曾國藩的角度來看，這件事他能躲開就儘量躲開，如果躲不開，能拖就拖。
曾國藩是官場上出了名的“痴傻”之人，所以對於他施行的“拖字訣”，慈禧也無可奈何，只好再下第二道命令，這時曾國藩才慢悠悠的到南京上任去了。
但是到了南京任上，曾國藩依舊採取的拖延戰術，他並不去調查案件，每天只是在家裡看紀曉嵐寫的志怪小說。直到刑部尚書鄭敦謹來了之後，曾國藩才調閱案件的卷宗，協同刑部尚書會審。
可即使如此，鄭敦謹也能明顯地感覺到曾國藩在“拉胯”。審理的時候，鄭敦謹一馬當先，像是個“大前鋒”，而曾國藩不管什麼事情，能推就推，能拖就拖，能不管就不管。於是，鄭敦謹賣命的審理了半個月，還是一無所獲。
雖然鄭敦謹是堂堂的刑部尚書，可他很清楚，兩江地區其實是曾國藩的天下。試想曾國藩在官場摸爬滾打幾十年，已經是出了名的“老油條”，他對於案件竟然如此的不上心。鄭敦謹心裡也有了數，想必這背後的一些事情不能深究。
所以，鄭敦謹最後只好和曾國藩聯名上奏，說之前張之萬審理的結果是正確的。慈禧得到這個訊息，內心估計更是如火山噴發般惱火。
可惜曾國藩樹大根深，又在兩江使她鞭長莫及，而且也沒有什麼把柄拿捏住他。最終，馬新貽不管是不是慈禧的人，慈禧都得接受他不明不白就死去的事實。
此後，刺客張文祥被凌遲處死。曾國藩雖然沒有再被調離兩江，但是一年多之後，他也病逝了。所以，這件刺殺案也就成了真正的懸案。
馬新貽被刺的諸多謎團
一個封疆大吏被輕易的刺殺，這讓很多人都難以相信，但是由於彼時的政治局勢錯綜複雜，所以這事即便有諸多的疑團，一切也都不了了之了。
一種說法是，當時江蘇巡撫丁日昌的兒子和馬新貽的一個幕僚為了爭奪一名風塵女子，發生了衝突，事後馬新貽將丁日昌的兒子抓了，而丁日昌出身於湘軍系統，所以這裡的湘軍系統策劃了對馬新貽的暗殺。
另一種說法是慈禧對曾國藩的懷疑。慈禧認定曾國藩的屬下在攻破太平天國之後，肯定藏匿了不少的寶藏，所以才調馬新貽到兩江任上查此案。由於這牽扯到了湘軍系統的利益，所以馬新貽才被暗殺。
無論是哪種說法，事情看起來都對曾國藩不利。也有人說，這件事本身就是曾國藩在背後預設的。不過從事實上來看，曾國藩本人絕對不會傻到去落人口實地做這種事情。
但是曾國藩又非常清楚，雖然自己離開了兩江，可兩江地區還有自己很多舊部，馬新貽要是真的調查了他們，這些舊部可能確實會做出什麼事情來。
而自己是湘軍系統事實上的核心人物，這件事一旦發生，不管自己在哪裡都難以摘除乾淨。所以最好的做法就是拖和賴。曾國藩當然不會去深入徹查此案，得罪了舊部不說，也更容易讓朝廷懷疑自己的能量依舊還在。
採取拖著不處理的方式，無論是對上還是對下，這都是一件可以糊弄過去的事情。對慈禧來說，雖然她清楚這背後有陰謀，但是由於要依仗曾國藩，所以也無可奈何。而對於曾國藩的部下來說，正是因為吃準了朝廷和曾國藩的心思，所以才敢把事情做得這麼絕。
說來說去，馬新貽不過是曾國藩和慈禧博弈下的犧牲品罷了。不管他有沒有在查湘軍系統，因為他讓人產生了這樣的聯想，所以最終只能以這樣的方式死去。審理此案的刑部尚書鄭敦謹，也正是因為透過此案看到了官場的黑暗，所以事後就辭官回鄉了。