建文四年（1402年），朱棣的燕軍兵臨南京城下，歷時三年多的靖難之役算是有了結果，侄子皇帝沒鬥得過叔叔燕王，從此明朝皇位落入了朱棣一脈。
接下去朱棣要面對的，是歷朝歷代皇位之爭的常規操作——斬草除根。這時候，建文帝和他兒女們的行蹤去向，就顯得十分關鍵了。
朱棣要滅建文帝，當時存在著一個難以逾越的合法性問題，因為建文帝的皇位，是正兒八經從爺爺朱元璋那裡繼承來的，是名正言順的明朝“二代目”。
而且朱棣當初起兵時，打的是清君側的旗號，對外宣告自個兒不是造反，更不是為了奪位，而是行使朱元璋授予給藩王們的權力，履行清除皇帝身邊壞人的義務。
既然是清君側，那就是說朱棣承認建文帝“君”的身份，以及這個侄子皇位的來源合法。
但朱棣的燕軍和建文的南軍，真刀真槍、血肉橫飛地互砍了三年多，現在還讓建文帝屁股坐在皇位上，天底下哪有這麼便宜的事？最好的結果就是建文帝自殺，省的朱棣礙著“弒君”的罪名為難。
嘿！這時候的建文帝還蠻識趣，竟然點著皇宮自焚了！
不過朱棣還是沒能樂開懷多久，因為建文帝不見了！而且還有太子朱文奎，也一起下落不明瞭！
建文帝失蹤時年紀還很輕，只有25歲，剛繼位又趕上朱棣的靖難之役，估計沒時間也沒心思花在生孩子上面，所以這一脈留下的兒女不是很多。
1395年，洪武二十八年，在朱元璋的安排下，18歲的皇太孫朱允炆娶了光祿少卿馬全之女為正妃，也就是建文帝的馬皇后，後來在朱棣破城後自焚而死。
馬皇后為建文帝生下了兩個兒子，長子是洪武二十九年（1396年）生下的朱文奎，建文元年以嫡長子的身份被立為太子。建文三年（1401年），馬皇后又生下次子朱文圭。
朱棣兵圍皇宮時，朱文圭已經有7歲，擱在現在也到了上小學的年紀，有一定的行動能力。
他和父親建文帝一樣，此後去向成謎，而且相比於建文帝在外界行蹤的各種傳說，太子朱文奎可以說是杳無音信。各個版本的建文帝動向版本，都沒提到他身邊還帶著這個兒子。
陰謀論的觀點認為，建文帝是被朱棣控制後秘密暗殺了，然後以火堆中燒成面目無法辨認的兩具焦屍，對外宣稱建文帝和馬皇后自焚而亡。
既然如此，朱棣幹嘛不再往火堆里加一具小孩的屍體，把太子朱文奎也列入死亡名單呢？要知道以朱文奎的身份，如果建文帝身亡，他可是最有資格繼位的太子啊！
因此朱文奎的去向，最大的可能就是在皇宮亂糟糟的那段時間，就此失蹤了，而不是死於朱棣所謂秘密的斬草除根。
這樣的判斷，比較合理的依據，就是朱棣對建文帝另一個兒子朱文圭的態度和處置。
相比於去向成謎的哥哥朱文奎，朱文圭的人生軌跡，在明朝的官方史書中十分清晰。
當時的朱文圭只有2歲，朱棣在皇宮中找到這個僅存的侄孫後，並沒有痛下殺手，而是派人將他送往朱元璋的老家安徽鳳陽的廣安宮，由守陵的太監看管，還取了一個“建庶人”的名號，算是給了一個特殊的“落葉歸根”處置。
儘管朱文圭失去了自由，從小到大被圈禁在宮殿裡，但畢竟保住了性命，飲食起居日常也有人照料，應當說是不幸中的萬幸了。
參考朱文奎的待遇，朱棣如果先前真的控制住了太子朱文奎，大機率也不會對他下殺手。因為若是忌憚朱文奎的太子身份，那朱文奎呢，有嫡次子名分的他，不照樣可以有繼承建文帝皇位的法理嗎？
現實是朱棣只是軟禁了朱文圭，所以朱文奎要是在朱棣手裡，應該也是離不了高牆內的生活。
建庶人朱文圭從2歲開始，一直呆在鳳陽廣安宮的一畝三分地內，整整就是55年。
直到1457年，朱棣兒子的兒子的兒子明英宗朱祁鎮，下令解除對建庶人的圈禁。
明英宗之所以大發善心，其實跟他自己也有類似的遭遇有關。
1449年，當時還是熊孩子的英宗，在太監王振的慫恿下御駕親征，去征討瓦剌。
結果，這對敗家的CP組合一把牌就輸光了明朝一半的家底，將朱棣組建的京城三大營折騰了個精光，就連英宗本人也被瓦剌人俘虜，到草原上吃了一年烤羊肉。
虧了血本的明朝倒也不認慫，在於謙的主持下，文臣武將擁戴監國的郕王朱祁鈺當新皇帝，直接報廢了瓦剌人手裡捏著的王牌，不僅打贏了隨後的北京保衛戰，而且在一年後接回了英宗。
這下當皇帝上癮的朱祁鈺不幹了，對老皇帝哥哥是千防萬防，最後升級到了將他軟禁在了南宮，連大門上的鑰匙孔都灌滿了鉛。英宗夫婦困在裡頭，著實過了幾年十分憋氣的日子。
等到奪門之變英宗復辟成功，被囚禁的過往經歷，使得他開始同情起了鳳陽那個已經被關了50多年的建庶人，眼看著快60歲的朱文圭也沒了什麼威脅，於是就將他放了出來。
經特許，朱文圭遷移到鳳陽城內定居，還配備了十幾個供他使喚的奴才婢女，並且准許他娶妻生子。按照娶妻生子這條反推回去，豈不是朱文圭大半輩子，都沒經歷過夜生活？
這也證明圈禁中的他，已經與外頭的社會嚴重脫節，據說看到街上的牛和馬，也傻傻地分不清。估計是生活的反差一下子太大，重獲自由的朱文圭，沒過多久也就死去了。
至此，建文帝明面上的子嗣全部斷絕。即便有，也只能是那個靖難之役時下落不明的太子朱文奎，在民間留下的後代，不過這也已經無法考證了。