2008年10月5日，閻崇年在無錫參加圖書籤售會時，竟遭到一名年輕男子的掌摑。這名男子名叫黃海清，是一個民間史學愛好者。原來，黃海清平時十分關注各種歷史題材的節目和書籍，但當他聽到閻崇年在節目中提到“清軍屠殺是為了民族融合”的觀點後，感到十分不滿。
他認為閻崇年是在美化當年滿洲人入侵關內之後，為了建立清朝政權而對漢族人犯下的殘忍手段和行徑。黃海清希望能就這幾個問題與閻崇年一對一地進行交流，而閻崇年表示，與自己辯論歷史的人只能是歷史專業人才，不接受其他人前來探討歷史中的爭議問題。
黃海清是一個狂熱的歷史愛好者，他年紀輕、火氣大，曾一度認為閻崇年不願與自己爭論清史是看不起自己，因而他心中懷著一股怨氣，衝動地跑到圖書籤售會上掌摑了閻崇年。這件事情發生後，被人傳播到了網際網路上，引得一些不明就裡的網友連連叫好。
黃海清出手掌摑了閻崇年之後，有人當即報了警，警察趕到現場帶走了黃海清。
不過，黃海清儘管受到了處罰，但他一直拒絕向閻崇年道歉，理由是：閻崇年的言論過度美化了清朝，自己最痛恨這一點，故寧肯接受公安的處罰，也拒絕向閻先生承認錯誤。在警察局裡，黃海清闡述了自己掌摑閻崇年的理由，也無非就是歷史見解不合，又遭到閻崇年拒絕對話溝通。黃海清還是犯下了錯誤，除了被警方行政拘留之外還罰款1000元錢。
無論如何，動手打人最是不該。閻崇年當時已有七十歲高齡，最基本的尊老愛幼是漢人之美德，既然為大漢人民而抱不平，也應從自身做起。今天是文明時代，打人總歸是不對的，將暴力合法化有害無益。如果像校園暴力那樣，打人一頓只是因看人不爽，未免太過兒戲。
但閻先生在百家講壇的講座和其他一些公開場合的講座，對清朝曾過度美化，也是不爭的事實。
經過此事以後，黃海清一時名聲大噪，但是經過法律的制裁和道德的譴責後，黃海清毫無悔過之意，甚至還寫了《我為什麼要打閻崇年》一文，堅稱自己沒有過錯，拒絕向閻崇年教授道歉。人們不可能隔著螢幕去完全瞭解一個人，總有偏頗，總會失真，因而黃海清意氣用事，對閻崇年教授“掌摑”並且拒絕道歉。
黃海清在網上以“大漢之風”的筆名煽動群眾，並且羅列出了閻崇年的種種“罪狀”。
比如，他稱“皇太極5次入關，掠奪人牲97萬頭”，在這個言行中，閻崇年將人和牲口一起統計，並且還用“頭”來形容，在黃海清看來，這是對人的極大不尊重和侮辱。
再比如說，閻崇年在講《康熙帝的志與學》中，說“揚州十日”為促進民族文化的的融合做出了貢獻，但屠戮將近十萬人的“揚州十日”難道不血腥麼？
此後，在追隨黃海清的群眾中，有超過91。9%的群眾認為閻崇年應該被打，這顯然成為了“全民的狂歡”。
閻崇年教授也對網上的語錄做出了正面迴應，面對記者採訪時，他鄭重的宣告，“語錄”，完全不是我說的，純屬捏造。這些所謂的語錄極其不嚴謹，僅是有人整理的一份語錄，哪本書？第幾頁？閻崇年教授的哪次講話？語錄並沒有詳細嚴謹的說明。
“歷史是鏡子，也是藝術。它可以借鑑，更可以觀賞！我覺得挫折、坎坷都不怕，就是怎麼笑待這些坎坷和困難。”
這是閻崇年說過的一句話，對於他這個人，成名於百家講壇。
閻崇年是一個大學教授，2004年5月，閻崇年教授入《百家講壇》，帶來的系列節目《清十二帝疑案》。閻崇年教授以及他的《清十二帝疑案》，當之無愧地被觀眾朋友稱讚為“第一罈好酒”。
他在百家講壇的時候，尊重歷史，將以前的歷史都一一地敘述了出來，使得很多觀眾都對他喜歡，而閻崇年也在講歷史的時候，不過多的搬書古文，而是用自己的話語來敘述清代的歷史，而他幽默的講課方式，使得很多觀眾都非常的喜愛，甚至被媒體評為了清史的講述第一人。而有一些對歷史非常喜愛的觀眾，也是將閻崇年作為自己的偶像，因為閻崇年的力挽狂瀾，這才使得百家講壇這個節目沒有被中途換掉，而相反的是收視率一路高升成為了中央電視臺的優秀欄目。
閻崇年為什麼會稱滿清入關為民族融合呢？
一個民族，在其融化的過程中，必定是會發生武力鎮壓的，它需要將原本的兩個“國家”融合成一個，但兩邊文化會有分歧，該如何統一，如何去統一就成了一個問題。不服從管教的，拿武力才最有效。
在網上盛傳的閻崇年教授在《明亡清興六十年》裡，有“抑明揚清”之嫌？對於閻崇年教授而言，選定明亡清興這個選題，自然會偏向於講述明朝滅亡的原因，正常會講到明末的諸多弊端以及許多清朝取代明朝的優越性。
實際上歷史上的江陰便屬於無錫。在順治二年（1645年）發生的慘絕人寰的江陰屠城便發生在這裡，當時清軍入關，強制剃髮易服，江陰人民與清朝統治者之間的鬥爭。閻崇年教授在曾經深受滿清毒害的無錫，公然發行籤售滿清的書籍，的確沒有思慮周到，欠缺考慮。
所以說，我們作為旁觀者對任何事物都應該知道它的兩面性，這個世界上從來沒有任何事情是絕對的，就像閆崇年老師一樣他是優秀的歷史學家，但是並不代表著他是一個完美的人，他也會犯錯誤，難免會有自己疏於注意的地方存在。
他對滿清入關這一歷史事件的評價，我相信是經過了他自己理性的分析與判斷得出的，雖然其中肯定少不了有存在瑕疵與爭議的地方。
對於別人的看法，我們能聽則聽，不能聽不想聽可以離開，如要反對也需看看自己是否有議論與反對的資格，切不可為逞一時勉強，做出極為讓人厭惡的事情，做一個有道德與尊重別人人格與言論的人才是值得稱讚的。