經典狂犬病毒的分子流行病學（
四
）
——
大型學術專著《狂犬病（
Rabies）》
最新版選譯
第5章 分子流行病學（Molecular epidemiology）
作者：Susan A. Nadin-Davis
加拿大渥太華：加拿大食品檢驗署，渥太華
Fallowfield
實驗室。
（Canadian Food Inspection Agency， Ottawa Laboratory- Fallowfield， Ottawa， ON， Canada）
5.
4
狂犬病毒的分類
（
Lyssavirus taxonomy
）
5.4.1 麗沙病毒屬的物種（Lyssavirus species）
5.4.2 狂犬病相關麗沙病毒（lyssaviruses）的分子流行病學
5.4.3.經典狂犬病毒（RABV)的分子流行病學
（一
）
－（三
）
5.4.3.1
全球分佈世系（Cosmopolitan lineage）－（1
）
－（3
）
5.4.3.經典狂犬病毒（RABV)的分子流行病學
（
四
）
5.4.3.2 非洲2世系（ Africa 2 lineage ）
5.4.3.3 非洲3世系（ Africa 3 lineage ）
5.4.4.4 北極/北極樣世系（Arctic/Arctic-like lineage）
5.4.3.2
非洲2
世系（
Africa 2 lineage
）
非洲2
世系（
Africa 2 lineage
）包括一組與狗相關的狂犬病毒（RABV），目前在撒哈拉以南的西部和中部非洲廣泛傳播。據估計，這一世系出現在過去200年，並在整個非洲大陸緩慢地從東向西傳播，在這個過程中產生了多個區域限制性變種。已詳細研究了狂犬病毒在特定國家，如布吉納法索（Burkina Faso）、馬裡（ Mali）和迦納（Ghana）的流行，評估了與狗相關的非洲1世系和非洲2世系RABV在整個非洲大陸的系統發生和系統發生生物地理學現狀。
5.4.3.3
非洲
3世系（
Africa
3
lineage
）
獨特的非洲3世系
（
Africa
3
lineage
）包括一組已知在南非、波札那和辛巴威的貓鼬中傳播的病毒，儘管其真實範圍可能擴充套件到非洲其他地區。雖然黃貓鼬（yellow mongoose）是這些病毒在南非的主要宿主，但它們也經常在各種靈貓科（viverrid）物種（如辛巴威的果子狸）中被報道，這可能有助於病毒的維持。這一世系的變種具有高度的遺傳異質性和很強的地理分割槽特徵。有人認為貓鼬和犬科生物型別相關的病毒表現出不同的進化動力學，有證據進一步支援這一觀點，即非洲3世系，以及與
亞洲
白鼬
獾
（
Asian ferret badgers
）相關的病毒，進化速度是與狗相關的變種的4倍，這可能體現了這些病毒對宿主的適應。
5.4.3.4
北極
/
北極樣世系（
Arctic/Arctic-like
lineage
）
這一世系，最初被簡單地指定為北極世系，在歷史上被認為僅侷限於北美（加拿大和美國阿拉斯加）、格陵蘭和俄羅斯，特別是西伯利亞的北極和溫帶地區的紅狐和北極狐種群，偶爾有可能是來自俄羅斯的動物藉助浮冰冒險入侵遙遠的挪威斯瓦爾巴特群島（Svalbard archipelago）。
增加
北極
樣
(Arctic-like
，
AL)
世系
的名稱是為了承認其擴大的地理範圍延伸到溫帶以南的許多地區，現在看來，在向北和向西傳播產生真正的北極分支之前，這個分支出現在亞洲的某個地方。目前，該世系被分為三個主要的類群，不同的研究者對這三個類群的定義有所不同。
真正的
北極分支
（
arctic clade
）
進一步劃分為4種不同的型別，A1到A4，它們表現出不同的時間和空間分佈。
A1
只在加拿大南部發現過；
A2
在阿拉斯加以及俄羅斯的歐洲北部地區和法蘭士約瑟夫地群島（Franz Josef land）地區被發現，
A3
分佈於北美整個北緯地區和格陵蘭島，而
A4
僅限於阿拉斯加州，並根據地理位置再細分為兩個不同的分支。
另一組通常被稱為
北極樣
1 (AL1)
世系
，包括來自阿富汗、巴基斯坦、伊朗、尼泊爾、不丹、蒙古、孟加拉國和印度大部分地區的分離毒株，該組進一步細分為地理上區域性的分支。
最後一組通常被稱為
北極樣2
(AL
2
)
世系
，主要分佈在韓國、蒙古以及西伯利亞和俄羅斯的周邊地區；這種型別也存在於在1950年代根除狂犬病之前的日本。
所有
北極
樣
病毒
都在犬類中廣泛傳播，但野生犬科動物可能也有助於維持這些病毒的持續存在；例如，在韓國，貉（raccoon dogs）是該病毒的儲存宿主，而在印度，狐狸被認為是該病毒的儲存宿主。近年來，內蒙古以及中國北方其他地區發生了由北極樣病毒引起的狂犬病暴發流行，已經引發對這種動物流行病進一步擴大到全國其他地區的擔憂。