9月18日10時許，沙坪壩區公安分局食藥環偵支隊接到重慶市生態環境局通報稱，磁器口鳳凰溪匯入嘉陵江水面出現大面積油汙，散發著刺鼻的氣味，疑似有企業違規排汙。接警後，食藥環偵支隊支隊長立即親自帶領民警前往現場勘查。
因目前還處於汛期，嘉陵江水流較大，為避免上述油汙漂浮至嘉陵江，造成汙染急劇擴散和不可控的次生汙染，支隊民警會同區生態環境局立即採取行動，阻隔油汙匯入嘉陵江。
磁器口景區人流量較大，臨河建築多，環境複雜，為避免對附近居民生活造成影響並及時控制汙染源頭，支隊果斷啟動刑事案件調查機制，一方面實施現場控制，立即對汙染現場進行勘查並沿途溯源；另一方面走訪附近群眾，檢視影片監控，確定汙染物出現的時間和具體位置，同時將情況上報至分局。
民警克服河道泥濘難行的困難和落水的風險，深一腳淺一腳地沿著河道一步一步查詢，同時目不轉睛地檢視篩選20多個監控影片，經過3個小時奮戰，最終鎖定了汙染物源頭。
經查，9月18日2時58分左右，康明斯發動機公司汙水處理站排汙管道出現故障，加之工人操作不當，油汙經雨水沖刷擴散到排水管道和引洪渠，流入鳳凰溪。當事人侯某因擔心被單位處理而隱瞞不報，致使環保部門未能及時處理，引起大面積汙染。
經調查核實，確認該案為意外事故導致汙染物洩漏，不屬於刑事案件。有關單位和個人雖未主動排放汙染物，但該汙水處理站的裝置存在極大隱患，已移交環保部門責令整改並處罰。