無論是小智裡面的皮卡丘，還是口袋妖怪用來宣傳的的皮卡丘，毫無疑問都是公的。皮卡丘是有“性別差異”的精靈，尾巴的形狀決定了皮卡丘的性別。另外，動畫裡有很多暗示皮卡丘其實是個“可愛的男孩”，皮卡丘因為是個引人入勝的“浪子”而引發了很多“戰鬥”。
首先，皮卡丘是一個有“性別差異”的精靈。雌性皮卡丘和雄性皮卡丘有明顯的區別，主要在尾巴的形狀上。
“性別差異”是源於四代正面遊戲《珍珠/鑽石》的差異。同種精靈不同性別會有不同的外貌，具體到皮卡丘，就是尾巴形狀。
Lotom的插畫曾經強調過尾巴是心形的雌性，尾巴是方形的雄性。
所以小智的皮卡丘和用於宣傳的官方皮卡丘形象都是男性。因為小智的皮卡丘尾巴是正方形的。
“性別差異”的概念直到四代遊戲才體現在精靈的出現上。而《小智》中皮卡丘的男性則設定在第一代動畫中：
在故事中，當小智為最後一枚徽章發起攻擊時，小智和皮卡丘是靈魂伴侶，激動不已（雖然小霞一直在說冷嘲熱諷的話），而小智和皮卡丘的友誼則被定義為“男人之間的友誼”。可見皮卡丘至少在無印初期一直被設定為“少年”：
動畫之後不斷強調這是一個令人著迷的“可愛男孩”，也正因為如此，皮卡丘因為各種“爭風吃醋”的事情而捲入戰鬥：
在阿羅拉地區的皮卡丘谷，“新來的”皮卡丘很快引起了一隻雌性皮卡丘的注意，並很快產生了好感，注意到了它們尾巴上的差異。很快他們就開始“牽著尾巴”，這是皮卡丘特有的交流方式。皮卡丘主要是用尾巴感知周圍的變化。
情況是小智的皮卡丘“俘獲”了女皮卡丘的“心”。不過這很快就給小智裡的皮卡丘帶來了一些麻煩，很快又有一個“男”皮卡丘（注意尾巴）過來“招惹”。任何生物都會為求偶而戰，這是必然的。
很快就有了“戰鬥”可見小智裡的皮卡丘和官方宣傳用的皮卡丘都是男性，在皮卡丘裡都是相當有攻擊性的“帥哥”。
作為皮卡丘族群中的“帥哥”，被吸引的女寶可夢當然遠不止一個女皮卡丘，其他很多女寶可夢都是“一見鍾情”
所以毫無疑問，小智裡的皮卡丘和官方用於宣傳的皮卡丘都是男性。而且是萬人迷的“帥哥”。
因為“性別差異”直到四代遊戲（寶可夢IP成立十週年）才出現，第一代也沒有印刷動畫火，所以皮卡丘基本上是以“小智的皮卡丘”為原型參照物被選為口袋妖怪的官方“吉祥物”，所以一直是男皮卡丘代表口袋妖怪系列：因為這個系列的發展歷史，目前代表口袋妖怪系列的皮卡丘大部分都是男性形象。
一般來說，方尾皮卡丘會作為“正統”出現。雖然現在有很多“心型”皮卡丘，但還是比深入人心的男性皮卡丘形象差了一點。