馮偉萌 劉培
【摘要】：
為獲得甘肅省宕昌地區野生和栽培當歸轉錄水平差異，運用PacBio SMRT三代高通量測序技術測定當歸全長轉錄組，利用Illumina HiSeq X Ten PE150二代高通量測序技術進行野生和栽培當歸轉錄組差異表達測序分析，全長轉錄共獲得16。5 Gb資料，組裝得到113 906個轉錄本，平均長度1 466 bp。BLAST分析顯示分別有109 113（95。79%），93 276（81。89%），60 638（53。24%），48 928（42。95%），42 876（37。64%）條轉錄本在NR，Swiss-port，GO，KO，KOG資料庫得到註釋資訊，可歸為GO分類的生物過程、細胞組分和分子功能3大類，涉及128條KEGG標準代謝通路。2組樣品二代測序共獲得25 463條差異表達轉錄本，其中在野生當歸中存在高表達的有15 090條，在栽培當歸中存在高表達的有10 373條，對其進行GO和KEGG富集分析，差異轉錄本主要集中於植物-病原體相互作用（plant-pathogen interaction）、MAPK訊號通路-植物（MAPK signaling pathway-plant）和植物激素訊號轉導（plant hormone signal transduction）等通路。該研究利用高通量測序手段獲得當歸全長轉錄資訊，明確當歸遺傳資訊的整體特徵，透過比較野生當歸和栽培當歸在轉錄本層次的差異表達，為當歸優良種質資源的篩選培育、抗性研究和次生代謝途徑解析提供基礎資訊。