一、佛珠的數量，蘊含著不少秘密。
二、一味蘊：一種無始以來一味延續之細微意識，以作回的主題，謂其具有受。想。行。識四蘊。輾轉和合，轉成一味。
三、兩顆：調和之數（本沒有兩顆的解釋，也未見兩顆之數，有一種說法，一對的一般都是調和之數，類似陰陽成雙之意）
四、三顆指三寶：三寶是指佛寶。法寶。僧寶。
五、四顆指四緣：舊譯曰因緣。次第緣。緣緣。增上緣。新譯曰因緣。等無間緣。所緣緣。增上緣。
六、五顆指五乘：人乘。天乘。聲聞乘。緣覺乘。菩薩乘。
七、六顆指六門：眼。耳。鼻。舌。身。意六根也叫六門。
八、七顆指七妙法：又作七法。七知。七善。七善法。及知法。知義。知時。知足。知自。知眾。知尊卑。
九、八顆指八：八正道也。
十、九顆指九世：過去。未來。現在各具三世，合為九世。
十一、十顆指十利：指散見於諸經中之種種十利。
十二、十一顆指十一力：謂阿彌陀佛加持唸佛行者之十一種力用。及大慈悲力，大誓願力，大智慧力，大三昧力，大威神力，大摧邪力，大降魔力，天眼遠見力，天耳遙聞力，他心徹鑑力，光明遍照攝取眾生力等，以此十一力故，盡除一切魔事。
十三、十二顆指十二因緣。
十四、十三顆指十三力：一因力。二緣力。三意力。四願力 。五方便力。六常力。七善力。八定力。九慧力。十多聞力。十一持戒。忍辱。精進。禪定力。十二正念。正觀諸通明力，即成就正念。正觀六通三明之力。十三如法調伏諸眾生力。
十五、十四顆表示觀音菩薩的十四無畏。
十六、十五顆指十五尊：真言行者身上應安布之十五尊。
十七、十六顆指守護般若經及其持誦者之十六尊夜叉善神。
十八、十七顆指十七淨土。
十九、十八顆意義與一百零八相同為便於攜帶，遂六分之為十八，寓大於小而已。
二十、十九顆指十九說法：觀世音菩薩應眾生之機類而現十九種身以說法。
二十一、二十顆指二十力：謂菩薩所具足之十二種利用。
二十二、二十一顆表示十地。十波羅蜜。佛果等二十一位。
二十三、二十二顆指二十二門。
二十四、二十四顆指二十四願：阿彌陀佛之別願。
二十五、二十五顆指二十五菩薩：謂隨彌陀來迎之諸菩薩。
二十六、二十七顆指二十七賢聖：謂四向四果之二十七種聖者。
二十七、二十八顆指二十八祖：禪宗所傳指二十八位祖師。
二十八、二十九顆指二十九種莊嚴。
二十九、三十顆指三十種外道。
三十、三十一顆指三十一色：合十三種顯色。十種形色。八種表色，共為三十一色。
三十一、三十二顆指三十二法器。
三十二、三十三顆指三十三觀音：觀世音菩薩為攝化而自在示現之三十三種形象。
三十三、三十四顆指三十四心斷結。
三十四、三十五顆指三十五佛：常住十方一切世界之三十五佛。
三十五、三十六顆指三十六部神王：又作三十六善神。（三十六顆，與一百零八意義相同，但是便於攜帶，遂三分一百零八顆為三十六顆）
三十六、下三十七顆指三十七道品。
三十七、四十顆指四十位：為梵網經卷上所說之菩薩修行階乘。
三十八、四十一顆指四十一位。
三十九、四十二顆四十二賢聖。
四十、四十八顆指四十八使者：密教之勝軍不動明王為守護持法行者，於其左右各現二十四位鬼王之身，稱四十八使者。
四十一、四十九顆指四十九重如意殿：指兜率天上如意寶珠鑄造之四十九重寶殿。
四十二、五十顆指五十法。
四十三、五十一顆指五十一心所。
四十四、五十二顆指五十二位。
四十五、五十三顆指五十三尊：密教金剛界三十七尊加賢劫千佛中之十六菩薩。
四十六、五十四顆表示菩薩修行過程中的五十四階位，指十信，十住，十行，十回向，十地和四善根。
四十七、五十五顆指五十五善知識：又作五十五聖。
四十八、五十八顆五十八戒：合稱梵網經所說之十重禁戒與四十八輕戒。
四十九、六十顆指六十華嚴。
五十、六十二顆指六十二見。
五十一、六十四顆指六十四眼：據往生要集捲上本載，阿鼻地獄之十八獄卒各具有六十四隻眼。
五十二、七十顆指七十空性論。
五十三、七十二顆指七十二天：乃合太山府君。五道大神。大吉祥天及六十九天而為七十二天。
五十四、七十三顆指七十三尊：金剛界曼荼羅之成身會，於五十三尊外加金剛部之二十天而為七十三尊。
五十五、七十五顆指七十五法：又作小乘七十五法。
五十六、七十七顆指七十七智。
五十七、八十顆指八十無盡：指無盡意菩薩所說之八十種無盡之法門。
五十八、八十一顆指八十一科：乃至大藏一覽集卷三所錄之般若明相八十一科。
五十九、八十八顆八十八佛：乃五十三佛與三十五佛之合稱。
六十、八十九顆指八十九心。
六十一、九十六顆指九十六種外道九十六種佛世前後出現於印度而異於佛教之流派。
六十二、九十八顆指九十八隨眠：又作九十八使。
六十三、一百零八顆表示求正百八三昧，而斷除一百零八種煩惱。
六十四、一百一十顆指一百一十善知識。
六十五、一千零八十顆表示十界各有一百零八種煩惱（十界）指迷與悟的世界，分為十種類：地獄界，餓鬼界，畜生界，修羅界，人間界，天上界，聲聞界，緣覺界，菩薩。