研究突破,劍橋團隊首次描繪人類新皮質發育中的細胞空間結構表達圖譜

英國劍橋大學 Sanger 研究所最近的一項研究採用 GeoMx 空間全轉錄組(GeoMx WTA)技術首次描繪人類新皮質發育過程中的細胞亞群、細胞空間結構和全轉錄組空間表達圖譜,並發現某些疾病(如自閉症)相關基因在大腦深層皮質中展現出空間富集的特徵。

研究突破,劍橋團隊首次描繪人類新皮質發育中的細胞空間結構表達圖譜

圖 1。 b, 發育中顳葉新皮質的細胞結構;c-e,針對孕期21周 FFPE 樣本的 GeoMx WTA 實驗設計

該項研究採用的 GeoMx WTA 技術可以在細胞水平的高解析度下實現對 18,190 個基因的空間原位雜交,結合下游的 NGS 技術極大提高了獲取空間表達資訊的檢測通量,支援研究人員全面分析不同空間分佈、不同細胞型別中基因表達模式的差異、細胞間相互作用的分子機制,以及深入探究皮質發育過程中全轉錄組表達水平的時空變化。

在這項研究當中,GeoMx WTA 對於福爾馬林固定、石蠟包埋樣本(Formalin Fixation and Paraffin Embedding,FFPE)成熟穩定的相容性,也為進一步的轉化醫學和臨床研究提供了巨大便利。

研究突破,劍橋團隊首次描繪人類新皮質發育中的細胞空間結構表達圖譜

圖 2: 不同細胞型別的空間全轉錄組表達圖譜

Cell type-specific WTA profiling

為支援廣大神經科學領域科研人員儘快加入空間生物學這一科技新領域,博奧晶典牽手 NanoString 並聯合 Illumina 共同舉辦面向中國地區研究人員的「空間全轉錄組神經科學創新大賽」。申請者提交一篇

500 字的利用 DSP 空間轉錄組技術進行神經科學研

究的創新思路摘要

即有機會參與評選,最終會評選出 4 名獲獎者

免費開展 GeoMx WTA 空間全轉錄組檢測專案。

申請時間:

2021 年 6 月 1 日至 7 月 15 日

獎項內容:

獲獎者可獲得免費的 DSP 空間全轉錄組(WTA)專案支援,每名獲獎者可免費檢測2個樣本,每個樣本可以選擇 24 個以內的 ROI(Region of Interest)。

申請資格:

目前任職或學習於科研機構/藥企/醫藥研發服務機構/醫院等單位,從事神經科學研究的科研人員。

獲獎公佈:

為了向申請該資助專案的科研人員提供更多的技術背景,博奧晶典將在

2021 年 6 月 16 日 10:00~11:00

開展一場關於空間多組學技術在神經科學研究應用的專題研討會。

研究突破,劍橋團隊首次描繪人類新皮質發育中的細胞空間結構表達圖譜

圖 3: a,  NanoString GeoMx WTA  實驗流程

本次研討會特邀請了 NanoString 的專家針對 GeoMx DSP 空間組學平臺、流程和應用案例進行重點介紹,並會設定問答環節供計劃申請的老師、同學進一步瞭解空間組學技術和本次創新大賽的具體情況。研討會詳情如下:

主題:

《空間多組學技術助力神經科學研究》

講者:

聶海生 PhD,市場拓展經理,NanoStringTechnologies

日期:

2021 年 6 月 16 日,星期三

時間:

北京時間上午 10:00~11:00

講座內容簡介:

組織的異質性和複雜的微環境是當前臨床和轉化醫學研究面臨的最主要挑戰之一。為了能解析如神經系統、腫瘤等複雜組織的細胞組成和功能、以及細胞群之間的互作分子機制,近年來基於組織原位分析的技術發展迅猛。

NanoString 最新推出的 GeoMx DSP 空間多組學技術,透過結合組織影像分析和高通量定量技術,能夠在組織切片原位實現蛋白組和轉錄組表達分析,評估組織微環境和細胞群間的相互作用機制,進而改善疾病分子分型、加快生物標誌物發現程序和實現潛在治療靶點的組織原位驗證。

至今為止,已有 70 多篇各類應用 GeoMx DSP 空間多組學技術的臨床研究型文章發表在Cell,Nature,Nature Biotechnology, Nature Medicine, Nature Cancer 等頂級期刊,將為轉化醫學課題帶來革命性的創新。本講座將圍繞目前空間轉錄組和蛋白組技術的原理、技術流程及該技術在神經科學相關研究領域的應用展開探討。

研究突破,劍橋團隊首次描繪人類新皮質發育中的細胞空間結構表達圖譜

講者簡介:

聶海生,2010 年博士畢業於荷蘭 Wageningen 大學,基因組學專業,研究方向為轉錄組調控機制和進化基因組學。2010~2019 年,曾就職於 illumina 公司,負責 NGS 和 Microarray 技術在各類基因組學應用的市場推廣。2019 年至今,任職 NanoString 公司市場拓展經理, 主要負責 NanoString 空間多組學技術在腫瘤、神經科學等各類轉化醫學市場的應用推廣。

參會入口

創新大賽活動已開始,讓我們一起開啟空間組學的探索和收穫之旅吧!

關於博奧晶典

博奧晶典科研服務,一貫秉承高質量的專業技術服務精神,自主開發和引進了一系列先進的高通量篩選和驗證平臺,在 20 年的歷程中為國內外眾多的科研院所提供科研服務,支援國內外科研機構及企事業單位發表 SCI 論文 1,900 餘篇,雜誌總影響因子超過 8,900 餘分。更多產品及優惠資訊,可以訪問微信公眾號。

關於 NanoString 生物技術

自從 2008 年《NatureBiotechnology》期刊以封面文章形式報道了 NanoString 的突破性技術後,至今已有近 3,000 篇應用該技術的生物醫學文獻。其中多篇文章發表在《Cell》,《NatureMedicine》等頂級雜誌上。NanoString 的 nCounterAnalysis 是最新一代的數字化多重核酸定量平臺,而 GeoMx®DSP 則是最新一代的空間多靶標分析系統。

該平臺完美結合組織病理學、免疫學與分子技術,支援多種具有挑戰性的樣本型別(如 FFPE 和組織晶片),並可獲得樣本中蛋白及全轉錄組水平的空間原位表達譜,可以稱為生物 GPS 定位系統。可以幫助研究人員加快生物標記的發掘和疾病機理的深入剖析,在轉化醫學與臨床應用中扮演越來越重要的角色。更多產品及優惠資訊,請聯絡 NanoString 生物技術中國分公司。

關於 Illumina 因美納

因美納公司致力於推動和激發基因組學的發展而不斷改善人類健康。專注創新使我們成為全球基因測序和晶片技術的領導者,併為全球範圍的科研、臨床和應用市場客戶提供專業服務。我們的產品廣泛應用於生命科學、腫瘤學、生殖保健、農業及其他新興領域。欲瞭解更多資訊,請訪問官網或微信公眾號。

內容稽核:劉果、張志衡

文章來源:NanoString

題圖來源:站酷海洛

參考文獻:

1、Roberts K, Aivazidis A, Kleshchevnikov V, et al。 Transcriptome-wide spatial RNA profiling maps the cellular architecture of the developing human neocortex[J]。 bioRxiv, 2021。

TAG: GeoMxNanoString轉錄空間技術