科舉制度沿襲了一千多年，是體制下固定的人才選撥方式，也是天下讀書人入仕的主要途徑。到了清末科舉制已經不能順應時代發展，隨著新式學堂的出現，廢除科舉已經勢在必行。對於清政府來說，廢除科舉並不難，難就難在如何善後。要知道數百萬的秀才、貢生、舉人一下子失去了登進之路，後果將是不堪設想的。
為此，清政府出臺了一些政策，對這些人進行了善後處理，並解決其安置問題。大致有三個辦法：
1，生員補考優貢、拔貢
為了給生員出路，將原先選撥優貢、撥貢的嚴格條件一併廢除，所有生員，除了年輕力壯可入師範學堂以及已入師範學堂者不準應考外，其餘均可以參加考試。1909年秋，在全國各省舉行優貢、拔貢補考，凡地方生員均由各府州縣官會同教官報送，八旗在京畿各省駐防生員由各管轄區地區的將軍、都統、副都統分別選送。
考官由各省學使擔任，並呼叫進士、舉人、優貢、拔貢出身者為閱卷官，應試者可以連續參加考試。試題中以史論一篇，四書義或經義一篇，均要求即日交卷。
新選取的優貢、拔貢出身者於次年向該省督撫領取諮文投呈學部，於五月到北京，六月參加朝靠。由於參考人數眾多，先在學部組織一次各省優貢、拔貢的考試，試題是四書一篇，史論一篇，然後派大臣閱卷，分別去取。經閱卷大臣評定，錄取一、二、三等。
按規定，一等及二等前十名，中年以下者委以七品小京官，年齡較大者則授予知縣；二等第十名以後，一部分授京官在各部司任職，另外一部分則授以外官，如鹽庫大使、州判、州同、縣丞等；三等者不予授官。
2，生員的考職
生員未取得優貢、拔貢出身的，准許以佐貳雜職分發試用。除挑入學堂充任教員、出遊遊學不予送考外，其餘生員均於優貢之年，由各州、縣官會同教官遴選保送應試。
考試於優貢試完以後，在省城由提學使分為兩場進行，頭場講經義、史論各一篇，二場試時務策兩篇。考試前在算學、輿地、財政、兵政、交涉、鐵路、礦務、警察、外國政法等科目中，認考某一科目報明，再試以專門題目，合校兩場以定是否錄取。
錄取比例一般是大省取一百名，中省取七十名，小省取五十名。考試成績一等的以巡檢任用，二等的以典史任用，由吏部分別銓選派送，並准許分省或在本省試用，考職限三科以後即行停止。
3，舉貢會考
舉貢會考，即給予考取州同、州判、縣丞、主薄、吏目等職，或給予教職。這種考職制度已於道光年間廢除，停止科舉後，為了拓寬原舉人、貢生的出路，仿照舊制，舉行舉人與恩、優、拔、副、歲貢的會考。
1906年清政府學部成立以後，奏定在三科內，每三年一次，保送舉貢若干名，按舉人四名、貢生一名計算。但是，已經有正式官職，或是學堂教官、學生定有獎勵者，或實缺教官、與未經朝考的優貢、拔貢人員，均不準保送。
會考分為兩場，頭場以經義，史論各一篇，第二場試各報考專門題目。錄取者赴京城再度應考，1907年4月清政府在保和殿舉行了舉貢會考，考試內容、方法與朝考相同。考試期間，由皇帝指派閱卷大臣六人、襄校官六人、內監試二人、外監試四人，這次會考錄取三百六十七人，根據考試成績分為三等。
舉人取一等及二等前十名者，分別在京城充任主事、中書、七品小京官等職，在外省則充任知縣；二等十名以後，分別任用為州判、監庫大使、府經歷、縣丞等職；三等者不予委派任用。
以上的這些舉措，雖然力度不如常年的鄉試，但在廢除科舉制後還是起到了一定效果，那些準備參加科舉的生員們畢竟也有一條進身之路，不至於十年寒窗付諸東流。但儘管如此，新式教育依然是主流，那些受傳統教育的讀書人只有少數人能成功轉型，成為可用之才。