透過夾河、藳城之戰，建文帝派出的朝廷軍隊損失慘重，朱棣終於將不利局勢扭轉過來。
建文三年（公元1401年）閏三月，擊敗平安後，朱棣率軍南下，經過順德、廣平，河北的郡縣大多投降。
四月，朱棣抵達大名，大名官吏迎降燕軍。
收到齊泰、黃子澄再次被罷官的訊息後，朱棣自然知道這不過是建文帝的緩兵之計，於是上書和談，請朝廷將吳傑、平安、盛庸等人所率兵力全部召還。
“將士皆曰：‘恐非誠心，姑以餌我。不然，吳傑、平安、盛庸之眾當悉召還，而今猶集境上，是奸臣雖出而其計實行。’”（《明史紀事本末》）
建文帝朱允炆看了朱棣的這份上書，拿不定主意，不知如何是好，於是召來方孝孺商量對策。
方孝孺認為，燕軍停留在大名，天氣暑熱難當，時間一長，應不戰自疲；應急令遼東諸將進入山海關，攻打永平，同時令真定的兵馬進攻北平；燕軍必然回師救援，朝廷派軍緊隨其後，前後夾擊，必能將其擊敗。
而且，方孝孺建議暫且遣使回覆朱棣，拖延時間，使其軍心懈怠。
方孝孺起草了一份詔書，建文帝派大理少卿薛嵓帶著詔書前去燕軍大營，又將數千張傳單交給薛嵓，讓他秘密散發給燕軍將士，以動搖其軍心。
在詔書中，建文帝承諾，赦免朱棣父子及燕軍將士的罪過，恢復燕王的王爵，令其撤兵返回封地。
孰料薛嵓途中將傳單全都藏了起來，根本沒敢在燕軍營中散發。
朱棣接了詔書後，問薛嵓：臨行前，陛下說了什麼？
薛嵓回答：“上言殿下旦釋甲，謁孝陵，暮即旋師。”（《明史紀事本末》）
朱棣說，這連三尺小兒也騙不過。
薛嵓惶恐不安，不知如何對答。
朱棣留薛嵓在軍中數日，讓他參觀燕軍軍營，薛嵓被燕軍計程車氣所震撼，回去後如實稟報，方孝孺指責他為燕軍遊說。薛嵓後來果然投降了朱棣。
五月，盛庸、吳傑、平安等人都發兵襲擾燕軍糧道。
朱棣於是派指揮武勝等人前去京師，指責朝廷沒有罷兵的誠意。
建文帝朱允炆有些動搖，方孝孺勸說道：天下兵馬一散，很難快速重新聚集，燕軍如果長驅直入，進犯京師，我們如何應對？
“天下軍馬一散，即難復聚。彼或長驅犯闕，何以御之？”（《明太宗實錄》）
建文帝於是打消了罷兵的念頭，將燕使武勝等人擒拿入獄。
建文帝和朱棣和談破裂，繼續兵戎相見。
朱棣決定襲擊朝廷軍隊的糧道。六月，朱棣派都指揮李遠等人率六千輕騎從濟寧南下，讓他們換上朝廷軍隊的甲冑，在後背插柳枝作為標記，悄悄到濟寧、谷亭、沙河、沛縣等地，放火燒燬德州的運糧船隻，給盛庸造成嚴重困擾。
同時，彰德、尾尖寨等地的朝廷兵馬，也不斷襲擊燕軍南下的糧道。
於是朱棣派兵攻打彰德，彰德的守將趙清一邊據城堅守，一邊派人告訴朱棣，他不過是盡忠職守，“殿下至京師日，但以二指許帖召臣，臣不敢不至，今未敢也。”
趙清的表態耐人尋味，或許表明了當時各地守將的真實心態。
趙清的表態或許意味著，這些武將忠於朝廷，忠於皇權，忠於職守，守護一方百姓安寧，可是他們並不一定只忠於建文帝；對他們而言，建文帝與朱棣之爭只是明朝皇室的內部爭鬥，如果朱棣登基為帝，他們同樣效忠。
那麼，朱棣便沒必要與這些武將死磕，只需直接奪取皇位。